生化過濾依靠的是硝化細菌，硝化細菌的數(shù)量直接影響凈水效能。硝化細菌的數(shù)量和濾材的表面積有關：表面積越大就能附著越多的硝化細菌。有資料顯示，火山石的比表面積是300平方米/立方，K1是500平方米/立方。還有一種micro k1的東西，國內(nèi)電商平臺上面沒有見過，比表面積是950平方米/立方。常見的過濾還有沼澤過濾，這個屬于是被動過濾，濾材上的硝化細菌因為得不到足夠的氧氣，硝化反應比較慢，大多數(shù)商超暫養(yǎng)用的就是這種過濾，優(yōu)點是建造完成后基本無需維護。
在目前的發(fā)展水平下，循環(huán)水養(yǎng)殖模式較高的準入門檻使得循環(huán)水養(yǎng)殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養(yǎng)殖品種有限，限制了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的發(fā)展。近些年來，經(jīng)過專家學者和眾多的養(yǎng)殖企業(yè)的不斷探索，國內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)既是一個復雜的系統(tǒng)工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養(yǎng)殖品種的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，只要不出現(xiàn)明顯的設計漏洞，系統(tǒng)運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統(tǒng)管理技術和養(yǎng)殖技術來解決。
保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水質清新。光照強度500～2000勒克斯，光照均勻。根據(jù)要求調(diào)節(jié)水溫和換水量。養(yǎng)殖過程需按時測定水溫、pH值、溶解氧、鹽度、COD、氨氮、亞硝/酸鹽、硝/酸鹽、磷S鹽等相關指標，將各項指標控制在合適的范圍內(nèi)。當水溫高于20℃時，需要加大地下低溫海水的添加量和循環(huán)水量，并采取加大純氧供給量的措施，使氧氣飽和度達到100～150%（有液氧設施）。由于夜晚時間比較長，也是魚類生長速度比較快的時段，因此每天傍晚要堅持清潔養(yǎng)殖池一次，并進行一次池底排污操作，給魚苗創(chuàng)造一個良好生長的環(huán)境。