工廠化循環(huán)水從水處理的側重點不同分為機械模式和生化模式，主要區(qū)別就是看能耗大小，本文所講的是生化模式。這個模式能否成功，與虹吸能否順利運行有直接關系，虹吸設備需要時常維護否則會莫名其妙的失效。有人說：我都準備投入了30萬，你告我天天還得維護，這是搞毛線啊？虹吸失敗的話，整個系統視養(yǎng)殖密度在兩天到四天以內崩潰----魚蝦死光光。工廠化循環(huán)水系統的重點是凈水系統，占比50%；生物習性占30%；其他的溶氧恒溫等條件的占比20%。
生化模式凈水主要是靠硝化細菌，硝化細菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細菌掛膜需要濾材（細菌屋）；硝化細菌屬于好氧細菌，因此需要氧氣；硝化細菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細菌，或者添加一些其他已經掛膜的濾材進來進行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統應為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。
廣州環(huán)控農業(yè)生物科技有限公司針對改底這一種現象進行了大量的研究和試驗，發(fā)現流動的水體有助于池底的改善，再配合科學的喂養(yǎng)方式以及定期的池底清潔，能夠很好改善底部質量，從而改善水體質量。這種科學的養(yǎng)殖系統稱為循環(huán)水養(yǎng)殖系統，循環(huán)水養(yǎng)殖系統由多種循環(huán)水養(yǎng)殖設備構成，這一整套循環(huán)水養(yǎng)殖設備就是改善養(yǎng)殖水體質量的主要工具，適用于各種水產品種養(yǎng)殖。