在分解細菌的作用下，再進一步轉(zhuǎn)化成了氨。被魚類吃掉的一部分經(jīng)過魚類的消化，也轉(zhuǎn)變成氨。殊途同歸的氨在分子態(tài)時是一種劇毒物質(zhì)。在硝化細菌的作用下，它會被轉(zhuǎn)化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩(wěn)定的物質(zhì)。在高氧化還原電位的情況下，會被氧化成亞鹽。此時如果有反硝化細菌，鹽就會被轉(zhuǎn)化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個完整的轉(zhuǎn)化分離過程。 在實踐中，生物過濾的細菌需要適宜的條件才能起到相應(yīng)的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統(tǒng)設(shè)備與生物過濾器配套，更對操作者有一定的技術(shù)要求。
對于所有養(yǎng)殖石斑魚的養(yǎng)殖戶來說，能夠一下解決以上所有問題的方法就是采用室內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)備養(yǎng)殖石斑魚，室內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖也稱工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖，能夠很好的避免低溫對養(yǎng)殖石斑魚的影響。循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)備能夠*大化改善養(yǎng)殖水的水質(zhì)問題，避免水體環(huán)境的惡化，降低有害病菌的滋生，保證石斑魚健康成長。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的典型工藝和裝備是以物理過濾結(jié)合生物過濾為主體，對養(yǎng)殖水體進行深度凈化，并集成了水質(zhì)自動監(jiān)控系統(tǒng)，實時監(jiān)測并調(diào)控養(yǎng)殖水體質(zhì)量并可追溯。該系統(tǒng)具有工藝技術(shù)完善、水處理效果好、水質(zhì)狀況穩(wěn)定、生產(chǎn)操作舒適、設(shè)備維護簡便、運行成本低、系統(tǒng)投資省等優(yōu)點。這是一套簡潔有效的工藝技術(shù)路線：魚池出水自流進入微濾機池，去除殘餌和魚糞等顆粒直徑大于60微米的固體懸浮物質(zhì)，經(jīng)水泵提升進入生物濾器，一方面截流微小的顆粒懸浮物，另一方面對水體中的氨氮進行降解，凈化后的水自流回魚池。