生化模式凈水主要是靠硝化細菌，硝化細菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細菌掛膜需要濾材（細菌屋）；硝化細菌屬于好氧細菌，因此需要氧氣；硝化細菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細菌，或者添加一些其他已經掛膜的濾材進來進行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統(tǒng)應為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統(tǒng)要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。
水體的鹽度和硬度都能達到飽和進而析出，所以必須在系統(tǒng)內部放置植物?？梢栽谒w內放置水葫蘆、空心菜、浮萍等，也可以在硝化池種蔬菜比如西紅柿樹、地瓜樹、西瓜、土豆，矮化的果樹也是可以的。在水池內放置水葫蘆則需要注意不能被魚吃掉了。這樣植物還會遮光，避免魚被日光照射，同時還能收獲大量蔬菜和魚食。整個系統(tǒng)是需要日光的，一來是植物光合作用消耗肥水無機鹽，再就是給水體加溫，應盡可能的加大日光采集。
魚浮頭怎么辦？養(yǎng)殖水缺氧怎么辦？這時候就需要用到增氧機了，增氧機是一種常被應用于水樣養(yǎng)殖業(yè)的增氧設備，它的主要作用是增加水中的氧氣含量以確保水中的魚類不會缺氧，同時也能抑制水中厭氧菌的生長，防止池水變質威脅魚類生存環(huán)境。增氧機一般是靠其自帶的空氣泵將空氣打入水中，以此來實現(xiàn)增加水中氧氣含量的目的。