高密的養(yǎng)殖下，一旦系統(tǒng)崩潰、疾病爆發(fā)或循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)運(yùn)行的穩(wěn)定性和系統(tǒng)總水量的平衡、生物濾池的維護(hù)、過濾設(shè)施的定期清理、合理的投喂策略、適宜的養(yǎng)殖密度以及水質(zhì)的檢測和疾病的預(yù)防都是分不開的。因此，循環(huán)水系統(tǒng)的科學(xué)有效運(yùn)行是多學(xué)科知識(shí)的綜合體現(xiàn)。研究調(diào)查發(fā)現(xiàn)，很多企業(yè)對循環(huán)水養(yǎng)殖的原理、水處理設(shè)施設(shè)備的作用、運(yùn)行參數(shù)等知之甚少，直接影響到系統(tǒng)的運(yùn)行管理。較高的進(jìn)入門檻也進(jìn)一步加大了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的推廣難度。
循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)作為一種新型養(yǎng)殖模式，通過一系列水處理單元將養(yǎng)殖池中產(chǎn)生的殘餌糞便、氨氮（TAN）、亞硝(xiao)酸鹽氮（NO2–N）等有害污染物加以去除,凈化養(yǎng)殖水體環(huán)境為目的，利用物理過濾、生物過濾、去除CO2、消毒、增氧、調(diào)溫等處理將凈化后的水體重新輸入養(yǎng)殖池的過程。其不僅可以解決水資源利用率低的問題，還可以為養(yǎng)殖生物提供穩(wěn)定可靠、舒適優(yōu)質(zhì)的生活環(huán)境，為高密度養(yǎng)殖提供了有利條件。
我國是世界上水產(chǎn)養(yǎng)殖規(guī)模大的國家，但由于傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式存在的規(guī)范化程度低、養(yǎng)殖模式簡單、水資源浪費(fèi)大、污染嚴(yán)重等問題，導(dǎo)致產(chǎn)能嚴(yán)重滯后。近年，由中國水產(chǎn)研究院聯(lián)合相關(guān)科研和推廣部門，對工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)開展了全面研究。我國的南方地區(qū)海岸線長，網(wǎng)箱和土塘養(yǎng)殖發(fā)達(dá)，但存在各種魚、蝦苗種供應(yīng)不足和孵化育苗存活率低、臺(tái)風(fēng)等自然災(zāi)害較多、工業(yè)污染水源等問題。