在分解細(xì)菌的作用下，再進(jìn)一步轉(zhuǎn)化成了氨。被魚類吃掉的一部分經(jīng)過魚類的消化，也轉(zhuǎn)變成氨。殊途同歸的氨在分子態(tài)時(shí)是一種劇毒物質(zhì)。在硝化細(xì)菌的作用下，它會(huì)被轉(zhuǎn)化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩(wěn)定的物質(zhì)。在高氧化還原電位的情況下，會(huì)被氧化成亞鹽。此時(shí)如果有反硝化細(xì)菌，鹽就會(huì)被轉(zhuǎn)化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個(gè)完整的轉(zhuǎn)化分離過程。 在實(shí)踐中，生物過濾的細(xì)菌需要適宜的條件才能起到相應(yīng)的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統(tǒng)設(shè)備與生物過濾器配套，更對(duì)操作者有一定的技術(shù)要求。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的特點(diǎn)：一是用水量少，可利用較低質(zhì)水源，對(duì)水資源要求較低；二是占地少，對(duì)土地資源的要求低；三是養(yǎng)殖密度高，單位耗水產(chǎn)量大；四是易于控制生長(zhǎng)環(huán)境，魚類（以及其他養(yǎng)殖種類）生長(zhǎng)速度快，生長(zhǎng)周期短；五是飼料利用率高；六是水循環(huán)使用，利用系數(shù)高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對(duì)環(huán)境無壓力或很小；八是不受外界氣候的影響，可實(shí)現(xiàn)常年生產(chǎn)。
在水產(chǎn)養(yǎng)殖行業(yè)中，疾病一直是水產(chǎn)養(yǎng)殖戶所*忌憚的情況，養(yǎng)殖產(chǎn)品一旦感染病毒將會(huì)造成嚴(yán)重的損失，如果感染的是病毒性的疾病，造成的后果是很多養(yǎng)殖戶不能夠承受的。所以水產(chǎn)養(yǎng)殖戶們會(huì)花費(fèi)大量的人力物力去做預(yù)防疾病滋生的措施，但是結(jié)果卻不怎么理想，收效甚微，各種各樣的病毒層出不窮。