哈爾濱宏轉錄學組領域

來源: 發(fā)布時間:2021-12-28

circRNA轉錄組學成環(huán)機制:circRNA環(huán)化方式分為內含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為:依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上,通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點,索尾插接形成環(huán)化,然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側的內含子中含有反向互補序列,首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體,再通過可變剪切形成帶內含子和不帶內含子兩種不同的circRNA。或者外顯子內部以及兩側的內含子可以競爭進行RNA配對,然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。轉錄組學可應用于基因點突變及多態(tài)性檢測。哈爾濱宏轉錄學組領域

轉錄組學:轉錄組學是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉錄出所有RNA的學科,轉錄組測序是指利用高通量測序方法,研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉錄出的所有mRNA,用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達、結構的差異,闡明分子機制。應用領域:醫(yī)學研究:疾病標志物篩查、疾病的診斷和分型、疾病復發(fā)診斷、病因與病理機制探究、臨床療效評價、藥物毒理學評價。生命科學研究:非生物環(huán)境關系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應用、代謝途徑及功能基因組研究、藥用植物研究中的應用。湖北mRNA-seq轉錄組學方法轉錄組學可以直接測定每個轉錄本單核苷酸分辨率的準確度。

普通轉錄組學測序適用于哪些情況?普通轉錄組測序主要適用于兩大類:一是不同的生長階段或者發(fā)育過程;二是不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。轉錄組學測序必須做生物學重復么?需要幾個重復?生物學重復是生物實驗所必須的,轉錄組測序也不例外,至少3次生物學重復。準備生物重復樣品時,通過對實驗的預先設計和控制,盡可能將與實驗處理無關的背景條件控制在同一水平,減少批次效應對結果的影響。轉錄組學測序可以同時測到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么?我們通常所講的轉錄組測序只能測到mRNA。但是全轉錄組測序通過構建兩個測序文庫(一是小RNA測序文庫、二是lncRNA測序文庫)是可以測到以上4種RNA的。

轉錄組分析是目前應用比較廣的高通量測序分析技術之一。常見設計是不同樣品之間比較,尋找差異基因、標志基因、協同變化基因、差異剪接和新轉錄本,并進行結果可視化、功能注釋和網絡分析等。轉錄組的測序分析也相對成熟,從RNA提取、構建文庫、上機測序再到結果解析既可以自己完成,又可以在專業(yè)公司進行。概括來看轉錄組的分析流程比較簡單,序列比對-轉錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析。整個環(huán)節(jié)清晰流暢,可以作為剛開始接觸高通量測序學習比較合適的技術之一。轉錄組具有組織特異性的特點。

轉錄組學應用于胃腸瘤轉移機制研究:circRNA是一種非編碼RNA,可以多種方式參與生物學功能,如細胞增殖、細胞周期、侵襲和轉移等。近年來研究發(fā)現,環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結合蛋白參與轉錄后調控,從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復、凋亡、增殖、細胞轉運,以及介導瘤耐藥的細胞內酶,進而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調節(jié)作用。有研究證實通過干擾環(huán)狀RNA的表達,可以提高瘤對藥物的敏感性,提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點。普通轉錄組測序主要適用于不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。哈爾濱宏轉錄學組領域

什么是轉錄組學測序?哈爾濱宏轉錄學組領域

轉錄組學技術:轉錄組學(transcriptomics),是一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規(guī)律的學科。簡而言之,轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。轉錄組即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。優(yōu)勢:高通量、更精確的數字信號;在單核苷酸水平對任意物種的整體轉錄活動進行檢測;分析轉錄本的結構和表達水平的同時,還能發(fā)現未知轉錄本和稀有轉錄本;準確地識別可變剪切和融合基因。應用方向:植物生長機制的發(fā)現及干預;炎癥發(fā)生機制的發(fā)現及干預;表達差異的研究;基因點突變及多態(tài)性檢測。哈爾濱宏轉錄學組領域

上海拜譜生物科技有限公司致力于商務服務,以科技創(chuàng)新實現***管理的追求。拜譜生物擁有一支經驗豐富、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供多組學服務,質譜檢測,蛋白質組學,代謝組學。拜譜生物繼續(xù)堅定不移地走高質量發(fā)展道路,既要實現基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關鍵領域,實現轉型再突破。拜譜生物始終關注商務服務行業(yè)。滿足市場需求,提高產品價值,是我們前行的力量。