質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾：相對(duì)于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù)，質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對(duì)蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行分析，且可以對(duì)常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進(jìn)行補(bǔ)充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無(wú)法保證可以完全識(shí)別目的蛋白的特定翻譯后修飾，因?yàn)橘|(zhì)譜是通過(guò)蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個(gè)肽段來(lái)鑒定的，這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識(shí)別的機(jī)會(huì)。一種提高質(zhì)譜儀檢測(cè)到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進(jìn)行肽段富集，而不是使用PTM親和試劑進(jìn)行蛋白富集，這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)領(lǐng)域
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)：磷酸化蛋白質(zhì)是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到底物蛋白特定的氨基酸側(cè)鏈上形成的。蛋白質(zhì)磷酸化是一種可逆的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。在哺乳動(dòng)物的細(xì)胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和細(xì)胞代謝過(guò)程，且許多已知的疾病也與蛋白質(zhì)的異常磷酸化有關(guān)。因此，對(duì)磷酸化蛋白質(zhì)組進(jìn)行定量研究，尋找差異表達(dá)的磷酸化蛋白質(zhì)，有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標(biāo)。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)領(lǐng)域蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有簡(jiǎn)單的特性。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過(guò)可逆的共價(jià)鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合，調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號(hào)通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用，翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過(guò)實(shí)驗(yàn)的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點(diǎn)需要耗費(fèi)大量的資金和時(shí)間，并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實(shí)現(xiàn)。而計(jì)算的方法則能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點(diǎn)。
蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機(jī)制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過(guò)程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會(huì)導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?；?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開(kāi)關(guān)在時(shí)空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動(dòng)態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個(gè)氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對(duì)性地開(kāi)發(fā)和設(shè)計(jì)抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質(zhì)修飾可檢測(cè)修飾類型有磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙?；⒍□；⒈；?/p>
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略：目前，有幾種分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾的策略，包括質(zhì)譜（MS）、Eastern blotting、放射性標(biāo)記和Western blotting。放射性標(biāo)記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對(duì)定量的方法。該過(guò)程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質(zhì)譜技術(shù)也常被用于翻譯后修飾分析，不受修飾類型和相關(guān)修飾位點(diǎn)的現(xiàn)有知識(shí)的限制。自下而上：自下而上的技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中使用的質(zhì)譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前，需要使用蛋白酶消化蛋白質(zhì)。由于該技術(shù)不能保證在檢測(cè)過(guò)程中被檢測(cè)肽的完整性和穩(wěn)定性，因此無(wú)法獲得不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間關(guān)系的信息，這意味著它無(wú)法檢測(cè)到某些修飾。因此，該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。深圳丙二?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)服務(wù)
蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過(guò)可逆的共價(jià)鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)領(lǐng)域
乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析：乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析是指從蛋白質(zhì)組學(xué)的水平分析蛋白質(zhì)乙酰化修飾，包括乙酰化蛋白質(zhì)的鑒定和定量。提供基于質(zhì)譜的乙酰化蛋白組研究服務(wù)。蛋白質(zhì)乙酰化包括組蛋白乙?；头墙M蛋白乙酰化。組蛋白乙?；饕琴嚢彼嵋阴；言诨蜣D(zhuǎn)錄調(diào)控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙?；瘶?gòu)成了哺乳動(dòng)物細(xì)胞中乙?；鞍椎闹饕糠?，參與了所有主要生物過(guò)程，包括蛋白質(zhì)的定位、轉(zhuǎn)移、功能和降解，遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制等。除了重要的生物學(xué)功能以外，乙?；鞍踪|(zhì)及其調(diào)控酶還與衰老和多種疾病（如神經(jīng)變形紊亂、心血管疾病等）緊密相關(guān)。因此，對(duì)乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組進(jìn)行研究有助于進(jìn)一步探索細(xì)胞的生命活動(dòng)與了解相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)領(lǐng)域
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