河北病毒高通量測(cè)序進(jìn)化分析要多久

病毒是由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成（如朊病毒）。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈DNA病毒（ssDNA）、雙鏈DNA病毒（dsDNA）、單鏈RNA病毒（ssRNA）、雙鏈RNA病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊病毒）。根據(jù)宿主類型的不同，可以分為噬菌體（細(xì)菌病毒）、植物病毒（煙花葉病毒）和動(dòng)物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。病毒全基因組測(cè)序（VirusWholeGenomeSequencing，VWGS），是指基于第二代高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列，解析編碼信息，并獲得相應(yīng)的變異信息。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn)：臨床微生物**出具報(bào)告，專業(yè)醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)報(bào)告解讀。河北病毒高通量測(cè)序進(jìn)化分析要多久

病毒全基因組測(cè)序、高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展在生物信息學(xué)分析方面，通過新的分析軟件的研發(fā)和原有分析軟件的升級(jí)，對(duì)測(cè)序所得數(shù)據(jù)的分析也變得更加可靠；除此之外，伴隨著BasSpace等服務(wù)的出現(xiàn)，進(jìn)行數(shù)據(jù)分析工作所需的設(shè)備成本也在逐步降低。將來，伴隨著高通量測(cè)序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析技術(shù)的不斷進(jìn)步，測(cè)序精度與可靠性的上升，測(cè)序與數(shù)據(jù)分析成本的下降，高通量測(cè)序技術(shù)會(huì)在各個(gè)領(lǐng)域得到應(yīng)用。在病原微生物檢測(cè)和鑒定應(yīng)用中，高通量測(cè)序技術(shù)勢(shì)必會(huì)成為不可或缺的技術(shù)并發(fā)揮越來越重要的作用。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)足夠靈敏和完善，方能獲得準(zhǔn)確、可信任的結(jié)果。北京病毒二代測(cè)序突變分析服務(wù)公司病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn)：不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物，樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡。

二代測(cè)序應(yīng)用的患者類型的推薦：共識(shí)明確指出了二代測(cè)序應(yīng)用的患者類型及使用的時(shí)機(jī)的意見:對(duì)于神經(jīng)系統(tǒng)急性傳染/血流傳染/呼吸道傳染患者，3天是二代測(cè)序使用的時(shí)機(jī)，在傳統(tǒng)方法(常規(guī)的生化檢查和培養(yǎng))3天未報(bào)陽性且經(jīng)驗(yàn)性調(diào)整無效時(shí)，強(qiáng)烈推薦二代測(cè)序檢測(cè)；對(duì)疑似病毒傳染患者，包括：疑似神經(jīng)系統(tǒng)病毒傳染和病毒性肺炎且病情持續(xù)進(jìn)展的患者，若完善傳統(tǒng)PCR檢測(cè)后依然未獲得明確的病原學(xué)證據(jù)時(shí)，強(qiáng)烈推薦二代測(cè)序檢測(cè)。對(duì)于疑似局灶性傳染患者完成常規(guī)的生物化學(xué)、培養(yǎng)或PCR檢測(cè)后，若未能獲取病原學(xué)診斷結(jié)果，推薦將二代測(cè)序作為檢測(cè)方法。而對(duì)于懷疑繼發(fā)性血流傳染患者：在原發(fā)傳染灶的病原學(xué)檢測(cè)為陰性或因各種因素?zé)o法送檢合適標(biāo)本的情況下，可考慮將血標(biāo)本的二代測(cè)序檢測(cè)作為二線檢測(cè)。

深度測(cè)序和個(gè)性化醫(yī)學(xué)的范式相比，P4醫(yī)學(xué)更強(qiáng)調(diào)早期預(yù)測(cè)和預(yù)防，強(qiáng)調(diào)對(duì)患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)的概念則是在基因測(cè)序普及的基礎(chǔ)上，將整個(gè)個(gè)體的各種信息如生理信息（通過可穿戴設(shè)備可以即時(shí)監(jiān)控和收集到）和腸道菌群變化、各種組學(xué)信息（深度測(cè)序測(cè)定）整合，進(jìn)行準(zhǔn)確的疾病分型、調(diào)整和預(yù)防。隨著老年化時(shí)代的到來及臨床資源的限制，基于這三種范式的健康管理和準(zhǔn)確診療將成為生物醫(yī)學(xué)研究與應(yīng)用的基本范式，走向大眾生活，正如當(dāng)年的計(jì)算機(jī)發(fā)展歷程一樣，會(huì)從原來的大型機(jī)器演變成可移動(dòng)的小型工具。醫(yī)學(xué)與健康的將來也會(huì)隨著深度測(cè)序的普及和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理能力的大幅度提高，而進(jìn)入個(gè)性化的大眾管理時(shí)代。病毒株都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究。

病毒全基因組測(cè)序定中利用病毒傳播過程中核酸序列上特定位置的變化來進(jìn)行分型，著重于區(qū)分不同型別病毒的來源，是我國調(diào)整防控策略的重要依據(jù)之一。傳統(tǒng)的病原微生物檢測(cè)手段包括形態(tài)學(xué)檢測(cè)、培養(yǎng)分離、生化檢測(cè)和免疫學(xué)檢測(cè)。這些方法檢測(cè)周期長、靈敏度低，對(duì)操作人員的技術(shù)水平要求比較高等因素；熒光定量PCR技術(shù)和等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)等分子生物學(xué)的檢測(cè)方法部分解決了上述問題，簡單快速，通過對(duì)核酸特異性序列的檢測(cè)，可在短時(shí)間內(nèi)快速判斷病原體的種類，但是這些方法無法進(jìn)行混合傳染鑒定和病毒溯源，隨著基因組學(xué)技術(shù)的發(fā)展，高通量測(cè)序技術(shù)已經(jīng)能夠做到不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)，可直接對(duì)臨床樣本中的核酸進(jìn)行高通量測(cè)序，然后與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)，實(shí)現(xiàn)傳染性疾病的溯源、檢測(cè)、分型和耐藥評(píng)估等多個(gè)方面，受到越來越多臨床和科研工作者的關(guān)注。全基因組測(cè)序能檢測(cè)個(gè)體基因組中的全部遺傳信息，準(zhǔn)確性高。河北病毒高通量測(cè)序進(jìn)化分析要多久

病毒全基因組測(cè)序產(chǎn)品特點(diǎn)：結(jié)果穩(wěn)定可靠。河北病毒高通量測(cè)序進(jìn)化分析要多久

能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的技術(shù)手段：早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前，對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后，可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高，讀長很長，但與此同時(shí)，擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力，由于流程繁瑣，加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用，該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言，可操作性不強(qiáng)，這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析，減少了工作量，增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試，開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序，該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評(píng)。河北病毒高通量測(cè)序進(jìn)化分析要多久