基于10XGeomics動態(tài)微流控技術(shù)，利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì)，形成短片段，單細(xì)胞ATAC測序在表觀基因組學(xué)水平上，揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問題，區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性，獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息，是單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的重要突破：分析每個(gè)細(xì)胞數(shù)千個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)開放區(qū)域，識別細(xì)胞類型和細(xì)胞狀態(tài)；識別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅(qū)動細(xì)胞類型和狀態(tài)之間基因表達(dá)差異的非編碼序列；探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當(dāng)前重要的多組學(xué)研究基因表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的手段。單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型。吉林10X Chromi...

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時(shí)，需要在細(xì)胞清洗和過濾之后測定細(xì)胞活力，這一點(diǎn)至關(guān)重要。測定細(xì)胞活力有許多種方法，烈冰多年單細(xì)胞測序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性，取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞。一旦過濾和清洗完成，可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備（如血球計(jì)數(shù)器或自動細(xì)胞計(jì)數(shù)儀）進(jìn)行定量。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù)，還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建，實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。武漢二代測序單細(xì)胞測序服務(wù)從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析，越來越...

對于單細(xì)胞測序而言，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類（cellcluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細(xì)胞測序項(xiàng)目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測序，特別是目的為圖譜研究時(shí)，需要通過提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此，單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù)，不同樣本來源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫、測序，以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù)，單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí)，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準(zhǔn)確性。烈冰斥巨資引...

10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，也是目前國內(nèi)和國際上公認(rèn)的單細(xì)胞測序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺技術(shù)，該平臺基于動態(tài)微流控原理，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞， 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫測序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測序成本。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析，只要您需要，烈冰提供全流程的無憂服務(wù)。寧波單細(xì)胞測序百萬通量平臺烈冰科技作為...

科研的魅力之處，在于無窮盡的探尋生命的本底，通過單細(xì)胞測序，我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致，那么不禁要問一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面，而不可否認(rèn)的是，此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄，像一個(gè)還未長大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。烈冰單細(xì)胞測序，助力您的深入科學(xué)探究。蘇州高通量測序單細(xì)胞測序百萬通量平臺多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)MappedBarcoded...

RNA測序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類強(qiáng)大的工具，可提供混合樣本的基因表達(dá)平均數(shù)據(jù)，幫助科學(xué)家開始揭示這種異質(zhì)性。隨后，技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細(xì)胞技術(shù)上達(dá)到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細(xì)胞類型特異的基因表達(dá)，從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動其表達(dá)模式的細(xì)胞異質(zhì)性。這讓研究人員能夠更詳細(xì)地表征組織異質(zhì)性，鑒定稀有細(xì)胞類型，并逐個(gè)細(xì)胞地仔細(xì)分析其分子機(jī)制。當(dāng)獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實(shí)的圖譜后，研究人員就有了更為堅(jiān)實(shí)可靠的知識基礎(chǔ)，并能在這個(gè)基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實(shí)驗(yàn)，以獲取更深入的可行動見解。經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)，為獲得示組織內(nèi)真實(shí)表達(dá)水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保...

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！測序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記（S...

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì)，因?yàn)檫@可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間，以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時(shí)間，它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn)，而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù)，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團(tuán)塊的速度更快。對于這些細(xì)胞，必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析，只...

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì)，因?yàn)檫@可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間，以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時(shí)間，它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn)，而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù)，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團(tuán)塊的速度更快。對于這些細(xì)胞，必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差十二年測序經(jīng)驗(yàn)，累計(jì)服務(wù)與5...

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您，詳情請咨詢烈冰生物。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定。上海烈冰單細(xì)胞測序服務(wù)公司單細(xì)...

10XGenomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，一列縱向孔道輸入細(xì)胞，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中。這時(shí)候，就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中。每一個(gè)油滴中會落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫。單細(xì)胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣，為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強(qiáng)有力的工具。福州烈冰單...

關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生...

截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇，從平臺應(yīng)用比例來看，應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點(diǎn)探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細(xì)胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Science多篇...

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencingbysynthesis）和大規(guī)模平行測序技術(shù)（massiveparallelanalysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如IlluminaSolexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構(gòu)建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3和5端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn)；3）Primerbindingsite，用于結(jié)合PCR引物...

烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu)，1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計(jì)），在單細(xì)胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提...

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細(xì)胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制，微流體通道的直徑約為50~60um，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時(shí)，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗，對于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候，往往會遇到一個(gè)尷尬的問題，就是目標(biāo)細(xì)胞，例如神經(jīng)元細(xì)胞、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大，不適用于10X單細(xì)胞技術(shù)。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細(xì)胞直徑低于50um，但是成熟心肌細(xì)胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗，這也是為什么現(xiàn)...

單細(xì)胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個(gè)共同過程，即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA，然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫，從而測定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá)。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn)，并通過熒光測定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn)，而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析。然而，這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或...

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷，這對Single Cell分選標(biāo)記、建庫、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計(jì)數(shù)偏低，則會提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模...

作為單細(xì)胞測序的一個(gè)重要里程碑，10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution，此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記、測序和分析，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況，并通過對復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析，繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)細(xì)胞躍遷。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體，單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。全線搭建10x Genomics單細(xì)胞測...

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您！烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。武漢10X Chromium X單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析可視化RNA測序（RNA...

基于10X Next GEM技術(shù)，單細(xì)胞測序一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)檢測近萬個(gè)細(xì)胞，可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲3'端mRNA表達(dá)譜、如需和免疫組庫（TCR和BCR）的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時(shí)，即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析，監(jiān)測免疫療法的效果，研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制，可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫測序： 烈冰單細(xì)胞免疫組庫平臺具備：1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)獲取1000-20000個(gè)細(xì)胞的文庫構(gòu)建，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)； 具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程，獲取V(D)J全長序列的配對信息；豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，實(shí)現(xiàn)專屬個(gè)性化數(shù)據(jù)分析服務(wù)，搭配...

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencing by synthesis）和大規(guī)模平行測序技術(shù)（massive parallel analysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如Illumina Solexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構(gòu)建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3'和5'端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn)；3）Primer binding site，用于...

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨(dú)運(yùn)作的，而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng)，這些合在一起實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運(yùn)作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對于了解生物系統(tǒng)如何運(yùn)作至關(guān)重要?！睘榱送苿涌茖W(xué)發(fā)現(xiàn)，科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說，單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對基因表達(dá)及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進(jìn)行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問題上已證實(shí)是行之有效的。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。福州單細(xì)胞測序服務(wù)公司關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流...

關(guān)于10X Genomics單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 ：10X平臺在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、無細(xì)胞隨便、極少的細(xì)胞團(tuán)塊，且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10X Genomics平臺兼容。一般來說，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的，因此，必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn)，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織...

科技的發(fā)展讓單細(xì)胞測序已經(jīng)應(yīng)用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件，如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展，以及對多種用藥的反應(yīng)。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個(gè)需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液，或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核，進(jìn)而對于每一個(gè)單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測序得到結(jié)果的技術(shù)，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個(gè)問題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個(gè)組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么？免疫研究中，兩個(gè)具有非常強(qiáng)的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么？基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用，是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。重慶10X...

10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，也是目前國內(nèi)和國際上公認(rèn)的單細(xì)胞測序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺技術(shù)，該平臺基于動態(tài)微流控原理，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞， 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫測序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測序成本。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀(jì)元。北京高通量測序單細(xì)胞測序服務(wù)公司烈冰生物...

單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。過去的十年，我們是知識的承載者；現(xiàn)在，...

單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000，...

細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時(shí)間和空間順序發(fā)生，因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時(shí)間特異性和空間特異性。時(shí)間特異性可以通過收集不同時(shí)間點(diǎn)的樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問題，其以點(diǎn)陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性。單細(xì)胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣，為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強(qiáng)有力的工具。武漢二代測序單細(xì)胞測序多組學(xué)測序10X Genomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理。從橫向...

為什么需要單細(xì)胞分辨率？ 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜，有許多獨(dú)特的單體，也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個(gè)過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性。單細(xì)胞測序能夠在以一個(gè)細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究，闡明具體細(xì)節(jié)，構(gòu)建出一幅更大、更精細(xì)的圖譜，說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復(fù)發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。長春單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞上樣...