南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠原理

來源: 發(fā)布時間:2024-06-06

Co-IP的實驗步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質(zhì)。
2. 抗體結合:然后,將特異性抗體(針對已知蛋白質(zhì)之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白(誘餌蛋白)上。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 沉淀:接著,使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌:捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質(zhì)。
6. 洗脫和分析:免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析,如Western blot(WB)或質(zhì)譜分析,以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術ChIP的實驗設計。南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠原理

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免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因:
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低,則有幾種方法可以進行優(yōu)化。在結合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結合的組分。使用普通微珠預純化樣本還可以降低非目標分子的共純化。此外,還可以使用無關蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實驗中會出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會影響下游分析,則需要使用抗體通過共價連接固定至微珠的方法進行實驗,如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
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免疫沉淀(ChIP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(ChIP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。

免疫沉淀實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀樣本的制備。

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染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質(zhì)-DNA(染色質(zhì))復合物,并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學方法(抗體親和)沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
這項技術通過蛋白質(zhì)與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質(zhì)的靶基因,被廣泛應用于體內(nèi)轉錄調(diào)控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結合方面的研究。該技術常與DNA芯片和分子克隆技術相結合。
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免疫沉淀技術RIP的實驗方法。南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠原理

免疫沉淀(Co-IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(Co-IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
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世途科生物簡介:

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