溫州Co IP免疫沉淀磁珠原理

來(lái)源： 發(fā)布時(shí)間：2024-06-09

免疫沉淀純化所得抗原量低有多種原因，
A. 純化所得抗原量低
1. 抗原結(jié)合水平低
IP 應(yīng)用中出現(xiàn)低抗原結(jié)合水平的可能原因有很多，結(jié)合反應(yīng)所使用的溶液是重要原因之一。必須使用適合的緩沖液，有特定的pH和鹽濃度，可能還需要添加互作所需的輔助因子。IP 或Co-IP 中用于純化的抗體是影響得率的另一個(gè)重要因素。如果抗體本身易失活或與抗原結(jié)合微弱，則可能很難找到足夠溫和的條件，即能產(chǎn)生結(jié)合，又能保證在孵育和洗滌過(guò)程中結(jié)合可以穩(wěn)定保持。
2. 抗原洗脫水平低
在某些情況下，抗原與抗體或結(jié)合蛋白結(jié)合之間可能會(huì)發(fā)生極強(qiáng)的相互作用，傳統(tǒng)的洗脫緩沖液無(wú)法將其破壞。如果需要使用溫和洗脫緩沖液收集功能性抗原，則上述矛盾尤為突出。

免疫沉淀技術(shù)IP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。溫州Co IP免疫沉淀磁珠原理

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免疫沉淀技術(shù)RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）是一種用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)過(guò)程，并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。
RIP技術(shù)的原理是利用針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白的抗體，將細(xì)胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物沉淀下來(lái)。然后，可以通過(guò)分離純化，對(duì)這些復(fù)合物中的RNA進(jìn)行檢測(cè)，如qPCR驗(yàn)證或測(cè)序分析。
表觀遺傳學(xué)和RNA生物學(xué)領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對(duì)RNA潛能的這一新認(rèn)識(shí)帶動(dòng)了新方法的發(fā)展，使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。
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“免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的結(jié)合蛋白，進(jìn)行小規(guī)模的蛋白質(zhì)親和純化的實(shí)驗(yàn)。更確切地說(shuō)，IP是采用固定在微珠支持物(一般是瓊脂糖樹(shù)脂)上的特定抗體，從復(fù)雜的混合物中，純化單一抗原的實(shí)驗(yàn)。固定化蛋白質(zhì)復(fù)合物的組裝既可以分步進(jìn)行，也可以一步完成。

常見(jiàn)的加樣順序：抗體和樣本(如細(xì)胞裂解物)一起孵育，然后加入親和微珠，用于捕獲抗體-抗原復(fù)合物。也可以將抗體和微珠(通過(guò)抗體結(jié)合蛋白，如蛋白A、G或A/G等，直接或間接結(jié)合抗體)先進(jìn)行孵育，然后再加入含有抗原的樣本。當(dāng)抗原、抗體和固相支持物產(chǎn)生結(jié)合以后，充分洗滌微珠，再采用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液從支持物上洗脫抗原。

免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因：
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低，則有幾種方法可以進(jìn)行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標(biāo)分子的共純化。此外，還可以使用無(wú)關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中會(huì)出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會(huì)影響下游分析，則需要使用抗體通過(guò)共價(jià)連接固定至微珠的方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
免疫沉淀樣本的制備。

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Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用，其實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)如下：
1. 樣品準(zhǔn)備：Co-IP實(shí)驗(yàn)通常有兩種，一種是內(nèi)源性蛋白相互作用驗(yàn)證，一種是非內(nèi)源性蛋白相互作用驗(yàn)證。內(nèi)源性相互作用通過(guò)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染的方式將兩種蛋白轉(zhuǎn)染至同一細(xì)胞內(nèi)表達(dá)；非內(nèi)源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進(jìn)行預(yù)處理及細(xì)胞裂解獲得細(xì)胞裂解液。
2. 沉淀誘餌蛋白：利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體，抗體會(huì)與誘餌蛋白結(jié)合，利用磁鐵將磁珠拉下，同時(shí)誘餌蛋白會(huì)一起被沉淀出來(lái)。
3. SDS-PAGE及WB檢測(cè)：得到沉淀后，需要驗(yàn)證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復(fù)合物分離，隨后利用WB檢測(cè)是否存在靶蛋白。
4. 實(shí)驗(yàn)對(duì)照設(shè)置：為了避免“假陽(yáng)性”，需要設(shè)置正確的對(duì)照，包括陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照（Input組）。Input組為直接利用抗體對(duì)細(xì)胞裂解液進(jìn)行WB檢測(cè)，驗(yàn)證細(xì)胞裂解液中存在蛋白。
5. 結(jié)果真實(shí)性：確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的，而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。
免疫沉淀ChIP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠？深圳Protein AG免疫沉淀磁珠的選擇

免疫沉淀RIP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠？溫州Co IP免疫沉淀磁珠原理

RIP技術(shù)的優(yōu)勢(shì)在于：
1. 特異性：利用特異性抗體，可以精確地捕獲目標(biāo)RNA結(jié)合蛋白及其相互作用的RNA。
2. 應(yīng)用場(chǎng)景多：適用于研究RNA結(jié)合蛋白、miRNA、lncRNA等非編碼RNA與蛋白質(zhì)的相互作用。
3. 技術(shù)結(jié)合：RIP后的RNA可以用于多種下游分析，如qPCR、測(cè)序等，為研究RNA的功能和調(diào)控提供了重要信息。
RIP技術(shù)的限制包括：
1. 抗體質(zhì)量：需要高質(zhì)量的特異性抗體，否則可能得到假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果。
2. 非特異性結(jié)合：可能存在非特異性結(jié)合問(wèn)題，需要仔細(xì)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和對(duì)照來(lái)控制。
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標(biāo)簽： 支原體 免疫沉淀