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來(lái)源： 發(fā)布時(shí)間：2024-06-13

免疫共沉淀分析（Co-IP）實(shí)驗(yàn)原理與IP十分類似，基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體；但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原，而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實(shí)驗(yàn)中，已知抗原稱為誘餌蛋白，與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號(hào)分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等，蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時(shí)和十分穩(wěn)定之間。基本的Co-IP實(shí)驗(yàn)方案與IP相同，實(shí)際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是，還有許多其他因素需要考慮，例如，結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化，優(yōu)化時(shí)，需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實(shí)驗(yàn)是一種強(qiáng)大的技術(shù)，用于研究蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用，尤其是在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)、復(fù)制以及表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域。然而，像所有實(shí)驗(yàn)技術(shù)一樣，ChIP實(shí)驗(yàn)也有其優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)。
ChIP實(shí)驗(yàn)的優(yōu)點(diǎn)：
1. 體內(nèi)反應(yīng)的反映：ChIP提供了一種在體內(nèi)研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的方法，能夠真實(shí)、完整地反映結(jié)合在DNA序列上的靶蛋白的調(diào)控信息。
2. 全基因組覆蓋：ChIP技術(shù)可以覆蓋整個(gè)基因組，提供關(guān)于蛋白質(zhì)-DNA相互作用的視圖。
3. 適用于多種蛋白質(zhì)：ChIP可以用來(lái)研究組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子以及其他DNA結(jié)合蛋白。
ChIP實(shí)驗(yàn)的缺點(diǎn)：
1. 實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣。
2. 需要大量起始材料：ChIP實(shí)驗(yàn)通常需要大量的細(xì)胞或組織作為起始材料。
3. 交聯(lián)的影響：使用交聯(lián)劑可能會(huì)改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，從而影響抗體的識(shí)別和蛋白質(zhì)-DNA的相互作用。
4. 染色質(zhì)碎裂的分辨率：染色質(zhì)碎裂的效率和分辨率直接影響ChIP的準(zhǔn)確性，需要優(yōu)化以獲得結(jié)果。
5. 抗體質(zhì)量：抗體的質(zhì)量對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果至關(guān)重要，但高質(zhì)量、特異性強(qiáng)的抗體可能難以獲得或成本較高。
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免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu)，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒(méi)有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡(jiǎn)而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng)，而磁珠在得率，可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。

Co-IP的實(shí)驗(yàn)步驟：
1. 細(xì)胞裂解：首先，細(xì)胞或組織被裂解，釋放其中的蛋白質(zhì)。
2. 抗體結(jié)合：然后，將特異性抗體（針對(duì)已知蛋白質(zhì)之一的抗體）加入到裂解物中。這些抗體會(huì)特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白（誘餌蛋白）上。
3. 免疫復(fù)合物形成：抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后，形成免疫復(fù)合物。
4. 沉淀：接著，使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）來(lái)捕獲免疫復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合，從而拉下抗體以及與之結(jié)合的目標(biāo)蛋白和任何相關(guān)的相互作用蛋白。
5. 洗滌：捕獲的免疫復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。
6. 洗脫和分析：免疫復(fù)合物被洗脫并進(jìn)行進(jìn)一步的分析，如Western blot（WB）或質(zhì)譜分析，以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。
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免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟：
1. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的選擇：
2. 抗體的選擇：選擇特異性強(qiáng)、親和力高的抗體來(lái)捕獲目標(biāo)蛋白質(zhì)
3. 樣本的準(zhǔn)備：收集和準(zhǔn)備細(xì)胞或組織樣本。
4. 蛋白質(zhì)的裂解和釋放：選擇合適的裂解條件，如pH值、離子強(qiáng)度、去污劑等。
5. 蛋白質(zhì)濃度的測(cè)定：確定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度，以便于后續(xù)步驟的標(biāo)準(zhǔn)化。
6. 免疫沉淀的操作：將特異性抗體與裂解液混合，并在適宜的條件下孵育，以形成抗體-抗原復(fù)合物。
7. 非特異性結(jié)合的減少：通過(guò)預(yù)純化步驟去除可能的非特異性結(jié)合蛋白。
8. 洗滌：多次洗滌以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì)。
9. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的洗脫：使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫抗體-抗原復(fù)合物。
10. 后續(xù)分析：對(duì)洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步分析，如Western Blot.
11. 對(duì)照實(shí)驗(yàn)：設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)恼龑?duì)照和負(fù)對(duì)照，以評(píng)估實(shí)驗(yàn)的特異性和敏感性。
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免疫沉淀技術(shù)RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）是一種用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)過(guò)程，并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。
RIP技術(shù)的原理是利用針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白的抗體，將細(xì)胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物沉淀下來(lái)。然后，可以通過(guò)分離純化，對(duì)這些復(fù)合物中的RNA進(jìn)行檢測(cè)，如qPCR驗(yàn)證或測(cè)序分析。
表觀遺傳學(xué)和RNA生物學(xué)領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對(duì)RNA潛能的這一新認(rèn)識(shí)帶動(dòng)了新方法的發(fā)展，使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。
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世途科生物簡(jiǎn)介：

上海世途科生物科技有限公司是一家集研發(fā)、生產(chǎn)、銷售于一體的，為全球用戶提供生物試劑的生命科學(xué)企業(yè)。世途科生物（CYTOCH）匯集了一支由海內(nèi)外KOL組成的研發(fā)團(tuán)隊(duì)，他們?cè)谏锖突瘜W(xué)領(lǐng)域擁有相當(dāng)豐富的研發(fā)經(jīng)驗(yàn)，通過(guò)將化學(xué)與生物技術(shù)相結(jié)合，致力于現(xiàn)有技術(shù)難點(diǎn)突破、新技術(shù)研究，為相關(guān)科學(xué)研究者提供思路和解決辦法。

憑借著強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)馁|(zhì)量管理，通過(guò)產(chǎn)學(xué)研合作，加快客戶科研成果的轉(zhuǎn)化，不斷推動(dòng)行業(yè)的發(fā)展。

標(biāo)簽： 免疫沉淀 支原體