深圳crispr脫靶檢測(cè)CRO

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-05-22

CIRCLE-Seq,將gDNA打斷并環(huán)化,環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育,NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段,確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序,成本相對(duì)較低,能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估,安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù),幫助您挑選高度特異,脫靶率低的sgRNA進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。同時(shí),我們也協(xié)助您檢測(cè)分析基因編輯后細(xì)胞樣品的脫靶情況,通過(guò)各種高通量測(cè)序檢測(cè)技術(shù),我們能準(zhǔn)確的分析全基因組范圍內(nèi)的脫靶位點(diǎn),推動(dòng)CRISPR/Cas9技術(shù)在zhiliao藥物開發(fā)和臨床研究中的應(yīng)用。我們的優(yōu)勢(shì):靈敏度高:能檢測(cè)低頻脫靶突變★準(zhǔn)確性高:檢測(cè)結(jié)果可通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證★多種檢測(cè)方法可選擇以滿足不同的實(shí)驗(yàn)需求脫靶檢測(cè)安評(píng),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。深圳crispr脫靶檢測(cè)CRO

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以上長(zhǎng)期隨訪時(shí)間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型,具體產(chǎn)品的隨訪時(shí)間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期時(shí)間及發(fā)生率、受試者適應(yīng)癥和預(yù)期生存期、給藥途徑、以及長(zhǎng)期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數(shù)據(jù)的積累,研究者和研究申辦方可能會(huì)根據(jù)產(chǎn)品的存在情況、轉(zhuǎn)基因表達(dá)和臨床表現(xiàn)的持續(xù)評(píng)估情況,延長(zhǎng)或縮短長(zhǎng)期隨訪的持續(xù)時(shí)間。如果研究申辦方認(rèn)為其基因zhiliao產(chǎn)品安全性風(fēng)險(xiǎn)較低、無(wú)需開展長(zhǎng)期隨訪臨床研究,或者希望變更隨訪時(shí)間,應(yīng)合理說(shuō)明依據(jù)或變更理由并與藥品監(jiān)督管理部門進(jìn)行溝通。廣州crispr/cas9脫靶檢測(cè)分析育種脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。

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由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無(wú)疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來(lái)檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對(duì)標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測(cè)CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測(cè)假定脫靶位點(diǎn)再檢測(cè)的思路;與其他的評(píng)估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。

CRISPR基因編輯zhiliao發(fā)展如火如荼,但也有不少人對(duì)基因zhiliao的安全性提出擔(dān)憂,由于CRISPR技術(shù)是直接改變基因組DNA,其中任何的改變都會(huì)被長(zhǎng)久保留下來(lái),所以CRISPR對(duì)于DNA序列的任何改變都需要嚴(yán)謹(jǐn)?shù)陌踩u(píng)估。根據(jù)目前已經(jīng)公開的FDA關(guān)于基因zhiliao的指導(dǎo)文件,對(duì)于基因zhiliao安全性的評(píng)估可以簡(jiǎn)單總結(jié)為兩個(gè)方面:由于目前大部分CRISPR基因編輯zhiliao方案是基于CRISPR引起的DNA雙鏈斷裂和隨機(jī)突變進(jìn)行基因敲除,所以一類風(fēng)險(xiǎn)主要是指靶位點(diǎn)的隨機(jī)突變引發(fā)的安全風(fēng)險(xiǎn),如果出現(xiàn)大片段丟失、染色體重排等異常變化,都存在巨大的安全隱患。脫靶檢測(cè)技術(shù),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。

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近幾年,細(xì)胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個(gè)方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhiliao方案。另一方面,基于CRISPR基因編輯技術(shù)的眾多基因療法也進(jìn)展迅速,較早體外基因編輯療法較快今年年底能夠上市(CRISPR Therapeutics CTX001),體內(nèi)基因編輯療法取得了不錯(cuò)的臨床數(shù)據(jù)(Intellia Therapeutics NTLA-2001),使用CRISPR技術(shù)制造的通用型CAR-T療法也是免疫細(xì)胞療法發(fā)展的一大趨勢(shì)(Caribou Biosciences CB-010)。影響CRISPR靶向性效率和特異性的因素有哪些?廣州crispr/cas9脫靶檢測(cè)分析

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CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問(wèn)題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段,然后首尾相連成環(huán)狀DNA,這種方法很好地避免了DNA隨機(jī)斷裂造成的背景噪聲。實(shí)驗(yàn)的第二步是用Cas9切割環(huán)狀DNA,再連上接頭并進(jìn)行雙端測(cè)序,這樣就可以在一次測(cè)序中同時(shí)獲取切割位點(diǎn)的兩側(cè)序列,彌補(bǔ)了SITE-seq的另一個(gè)缺點(diǎn)。CIRCLE-seq從總體上來(lái)說(shuō)要優(yōu)于SITE-seq,但是將基因組DNA隨機(jī)打斷后成環(huán)的效率并不高,所以同一作者在3年后發(fā)表了CHANGE-seq,用Tn5一步法打斷基因組并加接頭,提高了成環(huán)效率,降低了起始基因組DNA的用量。深圳crispr脫靶檢測(cè)CRO