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dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結(jié)果偏差。體積誤差對(duì)于測(cè)量拷貝數(shù)濃度會(huì)產(chǎn)生偏差。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學(xué)顯微鏡觀測(cè)為主。分散體積的差異會(huì)增加拷貝數(shù)結(jié)果的不確定性,Emslie等使用光學(xué)顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數(shù)字PCR系統(tǒng)中每個(gè)微孔內(nèi)和孔與孔間的體積差異對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響程度。Corbisier等使用微滴數(shù)字PCR對(duì)6種不同質(zhì)量分?jǐn)?shù)棉籽粉質(zhì)粒DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進(jìn)行分析,優(yōu)化了液滴體積得到相應(yīng)校正因子,并使用該校正因子發(fā)現(xiàn)并校準(zhǔn)了運(yùn)行軟件中液滴體積不變的假設(shè)而引起的數(shù)據(jù)偏離,數(shù)據(jù)結(jié)果的一致性有明顯提高。數(shù)字PCR具有諸多優(yōu)點(diǎn),但也存在一定的不足,如成本高、儀器操作復(fù)雜、經(jīng)濟(jì)效益低等。上海賽默飛數(shù)字PCR
本次推出的全自動(dòng)數(shù)字PCR一體機(jī)可以適用于包括醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域在內(nèi)的多種應(yīng)用場(chǎng)景。對(duì)于可以實(shí)現(xiàn)早期篩查、早期診斷、用藥指導(dǎo)以及監(jiān)測(cè)的復(fù)發(fā)。對(duì)于病原體可以實(shí)現(xiàn)超多重檢測(cè),以利于快速診斷。在優(yōu)生優(yōu)育領(lǐng)域也可以實(shí)現(xiàn)更多遺傳性疾病的診斷和檢測(cè)。對(duì)于臨床應(yīng)用具有極大的潛力和價(jià)值。通過線上+線下的方式舉行了數(shù)字PCR2.0技術(shù)方案研討會(huì),來自醫(yī)療界的**學(xué)者共聚一堂,圍繞PCR技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用進(jìn)行交流和討論。歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。蘇州國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR品牌在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊(cè)證的申報(bào)。
在PCR進(jìn)行的過程中,首先是引物和探針分別結(jié)合,然后開始擴(kuò)增。如果一個(gè)微滴當(dāng)中有目標(biāo)基因的片段,Taqman探針就會(huì)被酶切碎,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離。在后面的檢測(cè)過程中,熒光基團(tuán)被激發(fā)光路激發(fā)之后就會(huì)發(fā)熒光。如果沒有,Taqman探針就不會(huì)被切碎,在后面的檢測(cè)過程中,熒光基團(tuán)吸收到激發(fā)光的能量,就會(huì)被淬滅基團(tuán)給淬滅,那么儀器就檢測(cè)不到這個(gè)微滴的信號(hào)。檢測(cè)的過程中,并不是說一個(gè)樣本中檢測(cè)到了幾個(gè)亮點(diǎn),這個(gè)反應(yīng)當(dāng)中就有幾個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因?yàn)槟繕?biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個(gè)發(fā)光的微滴中,可能有一個(gè)或者三個(gè)四個(gè),甚至更多個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對(duì)一的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
Drop-off實(shí)驗(yàn)包括兩個(gè)針對(duì)相同擴(kuò)增子的TaqMan探針:與野生型序列互補(bǔ)而與突變位點(diǎn)不發(fā)生互補(bǔ)的Drop-off探針和與突變型和野生型基因都互補(bǔ)的Reference探針(如圖1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探針和Reference探針都將與目標(biāo)雜交,產(chǎn)生雙重陽性信號(hào)(如圖1B,藍(lán)色群)。相反,如果存在突變的等位基因,即使一個(gè)核苷酸的突變也會(huì)阻止Drop-off探針與之雜交,因此只有Reference探針對(duì)目標(biāo)基因進(jìn)行退火,從而得到一個(gè)陽性信號(hào)。三重ddPCR檢測(cè)體系存在的問題:不同位點(diǎn)檢測(cè)體系之間的cross-reactivity。
引物設(shè)計(jì)(DesignPrimers):引物長(zhǎng)度(PrimerLength):18-25個(gè)堿基之間。短的引物更易于同靶序列結(jié)合,但過短的引物也更可能同基因組上的多個(gè)區(qū)域相結(jié)合而產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。更長(zhǎng)的引物會(huì)提高同靶序列結(jié)合的特異性,但過長(zhǎng)的引物(>30bp)同靶序列結(jié)合速度變慢,降低結(jié)合率。引物長(zhǎng)度和組成直接影響引物Tm值(PrimerMeltingTemperature)和退火溫度(AnnealingTemperatures)。引物的組成——GC%含量(GCContent):指引物總堿基中G和C堿基數(shù)量的百分比,該值應(yīng)在40-60%之間。如果模板序列的GC含量較高,推薦使用較高Tm值的引物。dPCR被稱作第三代PCR技術(shù),但dPCR技術(shù)的廣泛應(yīng)用逐漸顯現(xiàn)出一些不足之處。深圳全自動(dòng)多重?cái)?shù)字PCR價(jià)格
相同模板進(jìn)行 96 次擴(kuò)增,終點(diǎn)處產(chǎn)物量不恒定,但 Ct 值卻極具重現(xiàn)性。上海賽默飛數(shù)字PCR
naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),源于crystal微滴芯片數(shù)字PCR技術(shù),自動(dòng)化微滴生成和擴(kuò)增,每個(gè)樣本孔可實(shí)現(xiàn)6熒光通道的檢測(cè),智能化識(shí)別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時(shí)內(nèi)即可獲得至少6個(gè)靶標(biāo)基因的一定程度上拷貝數(shù)濃度,融合傳統(tǒng)微滴式和芯片式優(yōu)勢(shì),被稱為下一代數(shù)字PCR技術(shù)。只需一步移液操作,將PCR反應(yīng)液加載于創(chuàng)新型微流控芯片,naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)即可自動(dòng)生成單層平鋪的2D微滴陣列,隨后對(duì)每個(gè)微滴進(jìn)行溫度均勻一致的PCR擴(kuò)增后,進(jìn)行六通道熒光信號(hào)采集,計(jì)數(shù)陰陽性微滴,通過泊松分布計(jì)算獲得靶標(biāo)基因一定程度上拷貝數(shù)濃度。上海賽默飛數(shù)字PCR
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司位于廣州市黃埔區(qū)銳豐三街4號(hào)617房,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。雙螺旋科學(xué)儀器是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),一直“以人為本,服務(wù)于社會(huì)”的經(jīng)營(yíng)理念;“誠(chéng)守信譽(yù),持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,致力于提供高質(zhì)量的數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀。雙螺旋科學(xué)儀器以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。