美國微滴式數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-01

由于現(xiàn)有的商業(yè)化數(shù)字PCR設(shè)備在物理上只設(shè)置了2個(gè)檢測通道,所以存在一個(gè)明顯的短板:不能同時(shí)進(jìn)行多個(gè)位點(diǎn)的檢測。在樣品多位點(diǎn)的檢測中,就需要更多的起始樣品,但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實(shí)現(xiàn)多重檢測。為了考察利用數(shù)字PCR實(shí)現(xiàn)多重檢測的可能性,英國TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細(xì)胞肺相關(guān)的KRAS基因?yàn)闄z測對象,在Bio-Rad的數(shù)字PCR系統(tǒng)上通過3個(gè)三重ddPCR檢測體系來實(shí)現(xiàn)9個(gè)KRAS突變位點(diǎn)的檢測。數(shù)字PCR等新興技術(shù)要在臨床應(yīng)用上得到爆發(fā)式增長,有賴于LDT市場的放開。美國微滴式數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

對于檢測需要高靈敏度以及技術(shù)確認(rèn)的情況下,數(shù)字PCR技術(shù)也可以發(fā)揮重要作用。技術(shù)數(shù)據(jù)表明,數(shù)字PCR技術(shù)對的比較低檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。經(jīng)測試,數(shù)字PCR在檢測和診斷的某些方面優(yōu)于金標(biāo)準(zhǔn)qPCR,尤其是在低病毒載量樣本中,相比起qPCR,數(shù)字PCR特異性、靈敏度、重現(xiàn)性和檢測限受影響更小。因此,未來預(yù)計(jì)數(shù)字PCR技術(shù)也將在類疾病中得到更加廣的應(yīng)用。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測。通過數(shù)字PCR技術(shù)可建立多重?zé)晒怏w系,用于同時(shí)檢測比如非小細(xì)胞肺中常見的MET和HER2耐藥擴(kuò)增。有研究報(bào)道,使用數(shù)字PCR技術(shù)對436例非小細(xì)胞肺樣品進(jìn)行檢測,并挑選樣本驗(yàn)證了數(shù)字PCR與RNA fish的檢測一致性。結(jié)果表明,該數(shù)字PCR技術(shù)在保證了基因擴(kuò)增檢測準(zhǔn)確性的同時(shí),還節(jié)約了檢測時(shí)間。醫(yī)療系統(tǒng)認(rèn)證數(shù)字PCR樣品回收數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測。

dPCR的結(jié)果統(tǒng)計(jì)方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,通過不同檢測通道分辨不同顏色和強(qiáng)度,再根據(jù)分散液滴的數(shù)量計(jì)算待測基因的含量;另一種采用概率統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)處理方法,即通過泊松分布的方法對結(jié)果進(jìn)行分析。應(yīng)用概率統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)和對數(shù)據(jù)處理方法的模型直接關(guān)系著結(jié)果的準(zhǔn)確性和分析時(shí)間的長短。常用的統(tǒng)計(jì)方法是假設(shè)每個(gè)微反應(yīng)單元的體積相同,根據(jù)泊松統(tǒng)計(jì)計(jì)算拷貝數(shù),公式為:M=-Vx1n(1-x/)其中M是目標(biāo)總拷貝數(shù)量;V是微反應(yīng)單元數(shù)量;x是發(fā)光的微反應(yīng)單元數(shù)量。

數(shù)字PCR產(chǎn)品的發(fā)展,為不同場景下的多樣化核酸檢測需求提供了新的思路,尤其是在醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)方面,在 性疾病早期檢測、病癥的液體活檢、無創(chuàng)產(chǎn)前檢查等領(lǐng)域展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景。實(shí)現(xiàn) 性疾病早期高效檢測——以病毒為例,有病毒檢測、和臨床樣本病毒載量評估He監(jiān)測環(huán)境病毒載量二代熒光定量PCR檢測技術(shù)是目前病毒檢測的"金標(biāo)準(zhǔn)",但由于病毒探針結(jié)合位點(diǎn)突變、樣本病毒載量不足等原因,在臨床檢測過程中經(jīng)常出現(xiàn)假陰性結(jié)果,由于數(shù)字PCR具有更高的靈敏度、精細(xì)度,以及其適合痕量樣本檢測的特性,能夠檢測出熒光定量PCR檢測過程中錯(cuò)過的 ,可作為后者的補(bǔ)充。在人群篩查及臨床診療中,為科學(xué)選取采樣方式,需要評估不同臨床樣本病毒載量,如鼻咽拭子、血尿、糞便、肺泡灌洗液等,由于數(shù)字PCR可提供一定程度上量化指標(biāo),為采樣方法的選取提供了參考,從而提高檢出率。在外防輸入的戰(zhàn)略要求下,環(huán)境病毒檢測工作尤為重要,數(shù)字PCR可對低核酸豐度樣本進(jìn)行有效檢測,包括從不同環(huán)境中取樣的樣本,如病房、醫(yī)院衛(wèi)生間、實(shí)驗(yàn)室等等,在病情防控中起到了不可忽視的作用。此外,數(shù)字PCR的應(yīng)用場景還有病程不同階段的病毒載量評估、核酸參考品制備、抗病毒藥物研發(fā)等環(huán)節(jié)。dPCR可直接溯源SI國際單位制摩爾,適合單一、雙重及多重轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)研究,一次可識(shí)別不同的轉(zhuǎn)基因區(qū)域。

數(shù)字PCR技術(shù)是繼一代普通PCR、二代熒光定量PCR之后的第三代PCR技術(shù)。該技術(shù)將一個(gè)樣本分成幾到幾十萬份,分配到不同的反應(yīng)單元,每個(gè)單元包含一個(gè)或多個(gè)拷貝的目標(biāo)分子(DNA模板),在每個(gè)反應(yīng)單元中分別對目標(biāo)分子進(jìn)行PCR擴(kuò)增;擴(kuò)增結(jié)束后,將有熒光信號(hào)的微滴判讀為1,沒有熒光信號(hào)的微滴判讀為0,終根據(jù)泊松分布原理以及陽性微滴的比例,計(jì)算出待檢靶分子的濃度或拷貝數(shù)。定量:不再依賴于Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線,直接給出靶序列的起始濃度,實(shí)現(xiàn)真正意義上的定量。更高靈敏度與特異性:數(shù)字PCR可實(shí)現(xiàn)萬分之一稀有樣本的定量,可用于極微量核酸樣本檢測、復(fù)雜背景下的稀有突變檢測、表達(dá)量微小差異鑒定、單細(xì)胞基因表達(dá)等方面。數(shù)字PCR在分子診斷領(lǐng)域?qū)?huì)發(fā)揮巨大的作用,數(shù)字PCR適用于生物標(biāo)志物研究、拷貝數(shù)變異分析、微生物檢測、轉(zhuǎn)基因生物檢測、mRNA和miRNA檢測、基因相對表達(dá)研究等,并對遺傳病、、產(chǎn)前診斷的研究提供了一種全新的技術(shù)思路與手段,具有廣的、不可替代的應(yīng)用前景。dPCR在轉(zhuǎn)基因檢測方面的應(yīng)用仍處于研究和探索的階段。廣東雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR

Drop-off數(shù)字PCR檢測方法的**主要優(yōu)勢是能夠能夠在一個(gè)反應(yīng)中檢測到基因組序列范圍短的同源基因突變。美國微滴式數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

全自動(dòng)樣本制備系統(tǒng)DMX-1000配備氣流發(fā)生裝置和氣壓控制裝置,能夠?qū)崿F(xiàn)高精度壓力控制,結(jié)合**產(chǎn)品液滴生成芯片和微流控乳液滴生成技術(shù),DMX-1000可以在70秒內(nèi)快速、穩(wěn)定、高效地生成大小均一的微乳液滴。微滴數(shù)量可達(dá)2萬-60萬個(gè),粒徑范圍30-120μm,性能穩(wěn)定。除此之外,銳訊還提供微流控芯片的定制服務(wù),以滿足不同的液滴數(shù)目和尺寸要求。平板式快速擴(kuò)增儀TC-1000,不再使用傳統(tǒng)的96孔板,而是特制的液滴擴(kuò)增芯片;不再是傳統(tǒng)的“燒開水”加熱模式,代之以平板式單液滴層均勻受熱的方式。在這樣的改進(jìn)之下,TC-1000完成40個(gè)PCR循環(huán)只需約45分鐘(TC-2.0升級(jí)版更是把時(shí)間縮短到了25分鐘?。蠓s短了等待時(shí)間,提升了實(shí)驗(yàn)進(jìn)度。這對實(shí)驗(yàn)人員而言,無疑是莫大的福利——高效完成工作,不加班——愛工作,也愛生活。美國微滴式數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

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