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qpcr的檢測(cè)原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),利用實(shí)時(shí)積累的熒光信號(hào)監(jiān)測(cè)整個(gè)擴(kuò)增過(guò)程,然后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線來(lái)對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析。qPCR 主要是依賴于標(biāo)準(zhǔn)品制備標(biāo)準(zhǔn)曲線,進(jìn)而去確定未知樣品的濃度,因此是一種相對(duì)定量的方法。隨著PCR的循環(huán)進(jìn)行,染料熒光強(qiáng)度增加,從而檢測(cè)到定量反應(yīng)的DNA。SYBR Green是一種DNA插入染料,范圍廣用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針?lè)椒ū阋?,但是特異性沒(méi)有熒光探針?lè)椒ê?。q225pcr無(wú)需參比染料、無(wú)需定期校準(zhǔn),更加簡(jiǎn)化的操作流程與減輕的維護(hù)負(fù)擔(dān)只為更好地專注于實(shí)驗(yàn)。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)
內(nèi)標(biāo)在傳統(tǒng)定量中的作用:由于傳統(tǒng)定量方法都是終點(diǎn)檢測(cè),即PCR到達(dá)平臺(tái)期后進(jìn)行檢測(cè),而PCR經(jīng)過(guò)對(duì)數(shù)期擴(kuò)增到達(dá)平臺(tái)期時(shí),檢測(cè)重現(xiàn)性極差。同一個(gè)模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實(shí)驗(yàn),所得結(jié)果有很大差異,因此無(wú)法直接從終點(diǎn)產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標(biāo)后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準(zhǔn)確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。3.內(nèi)標(biāo)對(duì)定量PCR的影響:若在待測(cè)樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標(biāo),則PCR反應(yīng)變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應(yīng)中存在兩種模板之間的干擾和競(jìng)爭(zhēng),尤其當(dāng)兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時(shí),這種競(jìng)爭(zhēng)會(huì)表現(xiàn)得更為***。但由于待測(cè)樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無(wú)法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標(biāo)。也正是這個(gè)原因,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標(biāo),但仍然只是一種半定量的方法。珠海熒光定量qPCR儀采購(gòu)Taqman探針?lè)ㄒ蛱禺愋愿撸粡V泛應(yīng)用于等位基因鑒別、SNP分型、病原體和病毒檢測(cè)、多重定量等。
所有儀器的操作都基本一致。設(shè)置的時(shí)候包括反應(yīng)板設(shè)置(plate setup)和程序設(shè)置(program setup)。我們以 ABI StepOne為例,詳細(xì)看一下反應(yīng)設(shè)置:A. 首先是實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇:定量還是其他。我們命名為“BioTeke”,進(jìn)行“定量”實(shí)驗(yàn)。B. 實(shí)驗(yàn)方法的選擇:我們選用的比較Ct的SYBR Green方法, Fast程序,以cDNA為模板進(jìn)行。C. 目的基因的設(shè)置:有幾個(gè)目的基因和目的基因的名稱。D. 樣品的設(shè)置:包括哪個(gè)是實(shí)驗(yàn)組,哪個(gè)是對(duì)照組。以及負(fù)對(duì)照的設(shè)置和生物重復(fù)的設(shè)置。E. 對(duì)照組和內(nèi)參基因的設(shè)置:這個(gè)是為后面的定量做準(zhǔn)備F. 反應(yīng)程序的設(shè)置:PCR反應(yīng)程序的設(shè)置要根據(jù)不同公司的MasterMix。比如BioTeke的95℃ 2分鐘就可以DNA聚合酶(ABI的需要10 分鐘)。循環(huán)反應(yīng)是95℃15秒,60℃15秒的40個(gè)循環(huán)。溶解曲線程序采用儀器默認(rèn)設(shè)置就可以?;蛘呤莾x器說(shuō)明書上建議的程序。G. 反應(yīng)體系的設(shè)置:A-G這五個(gè)步驟簡(jiǎn)單設(shè)置好,可以保存,修改反應(yīng)程序或者立刻進(jìn)行反應(yīng)。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QPCR):一般用于檢測(cè)樣品中目的基因的表達(dá)量。比如:在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,構(gòu)建了目的基因的過(guò)表達(dá)載體,轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞后,實(shí)驗(yàn)中需要在轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平檢測(cè)目的基因的表達(dá),轉(zhuǎn)錄水平就需要用到QPCR,蛋白水平就是WB。也可用于檢測(cè)基因組DNA中目的基因的拷貝數(shù)。主要步驟:從細(xì)胞/血液/組織中提取RNA,檢測(cè)RNA純度-去除基因組DNA-逆轉(zhuǎn)錄成cDNA-配置QPCR預(yù)混液-QPCR96孔板排版加樣,3個(gè)復(fù)孔-上機(jī)QPCR儀器檢測(cè)-據(jù)CT值分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。根據(jù)熒光類型主要分為熒光嵌合法(又稱為染料法)和熒光探針?lè)ā?qPCR熒光標(biāo)記法分為SYBR Green I染料法為主的熒光染料嵌合法,以Taqman探針?lè)橹鞯臒晒馓结樂(lè)?
qPCR和dPCR:研究人員已經(jīng)通過(guò)兩種方式克服了定量PCR分析的挑戰(zhàn):實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(dPCR)。qPCR主要使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan)。通過(guò)監(jiān)測(cè)PCR期間的熒光強(qiáng)度,可以比較多個(gè)樣品的DNA水平。數(shù)字PCR(dPCR)的基本工作原理很簡(jiǎn)單。先將樣品分為多個(gè)PCR反應(yīng),每個(gè)反應(yīng)多包含一個(gè)模板。然后通過(guò)對(duì)陽(yáng)性和陰性反應(yīng)進(jìn)行計(jì)數(shù)來(lái)確定初始樣品中模板分子的數(shù)量。盡管qPCR和dPCR都能夠定量樣品中的核酸,但它們有一個(gè)重要的區(qū)別。qPCR只能實(shí)現(xiàn)相對(duì)定量(例如,樣品A的目標(biāo)序列是樣品B的目標(biāo)序列的兩倍),除非使用此標(biāo)準(zhǔn)生成標(biāo)準(zhǔn)曲線。數(shù)字PCR本身是定量的,不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線。另一方面,qPCR技術(shù)更加成熟和眾所周知,市場(chǎng)上有大量商業(yè)產(chǎn)品可供選擇。dPCR仍然是小的新鮮肉。它不如qPCR使用且價(jià)格昂貴。與dPCR相比,qPCR更適合于高通量分析,并且動(dòng)態(tài)范圍廣。經(jīng)熒光定量PCR儀器檢測(cè)后,對(duì)核酸進(jìn)行定性和定量分析。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)
使用 PCR 擴(kuò)增 DNA 是當(dāng)今實(shí)驗(yàn)室的一項(xiàng)基礎(chǔ)技術(shù),創(chuàng)新不斷將其應(yīng)用范圍從研究實(shí)驗(yàn)室擴(kuò)展到臨床。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)
TaqMan qPCR:該測(cè)定不使用嵌入染料,而是使用帶有 5' 熒光報(bào)告染料和 3' 淬滅染料的 TaqMan 探針。 這些探針是目標(biāo)特異性的,并且在退火步驟中與引物之一下游的目標(biāo) DNA 序列結(jié)合。 當(dāng) Taq 聚合酶在延伸階段遇到 TaqMan 探針時(shí),它會(huì)置換并切割 5' 報(bào)告染料。 一旦報(bào)告染料與淬滅染料分離,其在每個(gè) qPCR 循環(huán)結(jié)束時(shí)的可測(cè)量熒光信號(hào)就會(huì)顯著增加。 第二條 DNA 鏈?zhǔn)瞧叫泻铣傻?,但由于沒(méi)有探針附著在它上面,因此無(wú)法通過(guò)熒光測(cè)量來(lái)監(jiān)測(cè)這一過(guò)程。與 SYBR Green 檢測(cè)相比,使用 TaqMan 探針的成本更高,但也具有兩個(gè)顯著優(yōu)勢(shì):TaqMan 檢測(cè)測(cè)量目標(biāo)序列的擴(kuò)增進(jìn)程,因?yàn)樘结樖悄繕?biāo)特異性的。您可以通過(guò)向主混合物中添加不同的引物和具有不同報(bào)告染料的 TaqMan 探針來(lái)監(jiān)測(cè)單個(gè)反應(yīng)中各種 qPCR 產(chǎn)物的數(shù)量。 這種多重方法允許您在每個(gè)熱循環(huán)結(jié)束時(shí)檢測(cè)多個(gè)熒光信號(hào)。佛山Quantagene q225qPCR儀材質(zhì)
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司致力于精細(xì)化學(xué)品,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)分為數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司秉持誠(chéng)信為本的經(jīng)營(yíng)理念,在精細(xì)化學(xué)品深耕多年,以技術(shù)為先導(dǎo),以自主產(chǎn)品為重點(diǎn),發(fā)揮人才優(yōu)勢(shì),打造精細(xì)化學(xué)品良好品牌。在社會(huì)各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造高質(zhì)量服務(wù)體驗(yàn),為客戶成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。