非靶向代謝組學(xué)研究:通過在三個(gè)成熟階段收獲兩個(gè)東方甜瓜品種的果實(shí)作者使用非靶代謝組學(xué)聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機(jī)酸在轉(zhuǎn)錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項(xiàng)研究運(yùn)用多組學(xué)技術(shù)聯(lián)合揭示了兩個(gè)品種成熟過程中關(guān)鍵的代謝和轉(zhuǎn)錄特征。在本研究中,通過代謝和轉(zhuǎn)錄組分析的綜合分析,研究了控制兩個(gè)東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機(jī)酸代謝的基因網(wǎng)絡(luò)。篩選了與糖和有機(jī)酸代謝相關(guān)的關(guān)鍵代謝物和候選基因,并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結(jié)果提高了對(duì)決定甜瓜發(fā)育和成熟過程中糖和有機(jī)酸積累和代謝的分子機(jī)制的理解。常用的代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。江蘇腸道菌群代謝組學(xué)
代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點(diǎn),并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機(jī)制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學(xué)分析中,發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中的樣品共鑒定出2466個(gè)代謝物峰,負(fù)離子模式631個(gè)、正離子模式下的1835個(gè);通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復(fù)組很容易區(qū)分(圖1B)。240個(gè)代謝物中有193個(gè)與COVID-19***相關(guān)(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對(duì)比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個(gè),嚴(yán)重組有59個(gè),恢復(fù)組有64個(gè);***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個(gè),重癥組有29個(gè),恢復(fù)組有34個(gè)。使用靶向代謝組學(xué)分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中59名受試者的血清代謝物(4個(gè)樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個(gè)代謝物分為16個(gè)簇;然后根據(jù)恢復(fù)組的代謝物是否恢復(fù)到正常水平將這些簇分為三組。北京質(zhì)代謝組學(xué)多少錢代謝組學(xué) 研究一站式服務(wù)平臺(tái)-專業(yè)代謝組學(xué)研究。
作者研究發(fā)現(xiàn)**酸過量會(huì)導(dǎo)致葡萄酒顏色變淺,但**酸干擾對(duì)酵母細(xì)胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均無***影響,隨后通過非靶代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)等技術(shù)研究**酸干擾過程中葡萄酒代謝物的變化,發(fā)現(xiàn)**酸過量會(huì)干擾酒精發(fā)酵過程中花青素的代謝,通過加速其異構(gòu)化來削弱花青素濃度,從而影響葡萄酒色澤,因而在葡萄酒生產(chǎn)中過程中應(yīng)避免**酸過量。通過非靶代謝組學(xué)技術(shù),能夠了解發(fā)酵過程中,發(fā)酵液代謝物的變化情況。了解到在糖酵解過程中,多余的PA會(huì)擾亂糖酵解和三羧酸循環(huán)的過程,從而深入了解葡萄酒發(fā)酵過程中顏色變化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年來,一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域,是國內(nèi)早期開展以蛋白組和代謝組為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實(shí)驗(yàn)與分析的團(tuán)隊(duì)。目前鹿明生物在頂空代謝組學(xué)研究已經(jīng)有了成熟的技術(shù)方法和多項(xiàng)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。
GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法:2021年10月,廣東石油化工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝,丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達(dá)的代謝物被下調(diào),表明有機(jī)磷阻燃劑對(duì)代謝功能和關(guān)鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機(jī)磷阻燃劑對(duì)環(huán)境產(chǎn)生的風(fēng)險(xiǎn)提供了新的見解。代謝組學(xué)行業(yè)解決方案和技術(shù)服務(wù)流程。
代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:2022年2月,中國海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)植物乳孢桿菌可以通過AI-2/luxs介導(dǎo)的群體感應(yīng)(QS)系統(tǒng)來調(diào)節(jié)其生長特性和代謝,該系統(tǒng)是參與食品安全的正調(diào)控因子,這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護(hù)控制潛力,特別是在食品工業(yè)生物技術(shù)中的應(yīng)用。歐易生物/鹿明生物提供專業(yè)的靶向代謝組學(xué)服務(wù)。江蘇代謝組學(xué)意義
代謝組學(xué)-對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析。江蘇腸道菌群代謝組學(xué)
尿液代謝組學(xué)研究案例,空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學(xué)特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)方法對(duì)尿液樣品進(jìn)行分析,其中GC-MS檢測(cè)102種代謝物,LC-MS檢測(cè)到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性,結(jié)果表明性別和季節(jié)對(duì)本研究的結(jié)果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明,Pu1和Po1之間的差異代謝物數(shù)量大于Po1和C之間的差異,LC-MS分析比GC-MS分析檢測(cè)到更多的差異代謝物,體現(xiàn)出不同平臺(tái)的檢測(cè)特點(diǎn)。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關(guān)的代謝生物標(biāo)志物,使用綜合分析獲得候選差異代謝物,其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關(guān)標(biāo)志物,確定了33種與短期暴露于空氣污染相關(guān)的差異代謝物,包括8種脂質(zhì)、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明,***富集到5種代謝通路,與免疫、炎癥、人類的環(huán)境壓力、缺血和缺氧有關(guān)。江蘇腸道菌群代謝組學(xué)
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng),具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。歐易生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對(duì)用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗(yàn)。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。