代謝組學(xué)經(jīng)典研究：本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學(xué)的經(jīng)典研究，***篇文章運(yùn)用LC-MS/GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)探究番茄果實(shí)成熟過(guò)程中的代謝變化。第二篇文章運(yùn)用16S rRNA測(cè)序+代謝組學(xué)技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長(zhǎng)和根際微環(huán)境的機(jī)制。第三篇文章運(yùn)用GC-MS頂空代謝組學(xué)探究新等位基因系和野生型的成熟種子中發(fā)現(xiàn)了幾種不同的揮發(fā)性化合物。第四篇文章運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)對(duì)對(duì)全氟辛酸（PFOA）暴露土壤栽培的黃瓜組織代謝途徑變化進(jìn)行了研究。非靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析 靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析。上海代謝組學(xué) 分析
LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究案例，中文標(biāo)題：使用無(wú)偏差代謝組學(xué)方法鑒定短期暴露于顆粒物和微生物氣溶膠中的青年人尿液生物標(biāo)志物研究對(duì)象：年輕健康志愿者發(fā)表期刊：EnvironmentalPollution影響因子：8.071發(fā)表時(shí)間：2022年4月17日合作單位：中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所衛(wèi)計(jì)委***生物工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院廣安門(mén)醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS代謝組學(xué)、GC-MS代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究方法探索 92 名年輕健康個(gè)體的尿液代謝組學(xué)特征，并確定與短期共暴露相關(guān)的潛在生物標(biāo)志物。上海代謝組學(xué) 分析代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析教程 代謝組學(xué)一般測(cè)幾個(gè)樣。
微生物組和代謝組學(xué)結(jié)果表明，高比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉比例能夠調(diào)節(jié)消化和粘膜相關(guān)的盲腸微生物群落和代謝特征。三種比例中，喂養(yǎng)含有50%高直鏈淀粉的飲食具有更好的結(jié)果，因?yàn)槠涔采?xì)菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacterium）的富集，戊酸鹽的增加以及促炎細(xì)胞因子的減少。代謝組學(xué)結(jié)果顯示盲腸組織的代謝特征發(fā)生了改變，包括脂質(zhì)肉堿和α-生育酚等代謝物的上調(diào)和下調(diào)。這些發(fā)現(xiàn)為直鏈淀粉/支鏈淀粉的比例是如何通過(guò)調(diào)節(jié)微生物發(fā)酵，導(dǎo)致共生微生物群和代謝物的增殖，從而改善斷奶山羊的盲腸環(huán)境提供了新的見(jiàn)解。本篇文章，檢測(cè)了喂食不同直鏈淀粉/支鏈淀粉比例的山羊的盲腸中SCFAs和炎癥因子的變化，并使用16s RNA測(cè)序檢測(cè)了不同組山羊的盲腸粘膜和消化物中微生物的變化，找到了變化的優(yōu)勢(shì)菌群以及菌群和SCFAs的相關(guān)性。再使用LC-MS/MS非靶代謝組學(xué)研究了不同組山羊盲腸組織的代謝物變化。通過(guò)多組學(xué)結(jié)合的方式，揭示了不同比例的直鏈淀粉/支鏈淀粉對(duì)山羊盲腸環(huán)境的影響。
GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法：2021年10月，廣東石油化工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果，通過(guò)GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法，發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝，丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達(dá)的代謝物被下調(diào)，表明有機(jī)磷阻燃劑對(duì)代謝功能和關(guān)鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機(jī)磷阻燃劑對(duì)環(huán)境產(chǎn)生的風(fēng)險(xiǎn)提供了新的見(jiàn)解。代謝組學(xué)-對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析。
LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究案例，中文標(biāo)題：***通絡(luò)***通過(guò)***和抗氧化作用預(yù)防及延緩糖尿病視網(wǎng)膜病變發(fā)展的機(jī)制研究研究對(duì)象：大鼠發(fā)表期刊：Biomedicine&Pharmacotherapy影響因子：6.529發(fā)表時(shí)間：2022年2月合作單位：中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院廣安門(mén)醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持)。文章通過(guò)對(duì)中藥***—***通絡(luò)方改善糖尿病病理方面的深入研究，表明在預(yù)防及***方面和微觀(guān)層面均起到了***效果。同時(shí)，也探究出***通絡(luò)方的內(nèi)在作用機(jī)制。也為糖尿病視網(wǎng)膜病變的早期***，提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)有助于對(duì)中藥成分進(jìn)行***的分析，為藥物機(jī)制提供參考。歐易生物助力靶向/非靶向代謝組學(xué)研究。浙江代謝組學(xué) 輪廓分析
非靶向代謝組學(xué) 土壤非靶代謝學(xué) 非靶脂質(zhì)組學(xué)研究。上海代謝組學(xué) 分析
代謝組學(xué)等多組學(xué)研究，2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對(duì)262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對(duì)**和*旁組織進(jìn)行了分析，通過(guò)繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。上海代謝組學(xué) 分析
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