歐易單細(xì)胞測序繼續(xù)發(fā)力！近日，歐易生物合作客戶浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院林俊教授、馬俊彥老師、張麗琪博士團(tuán)隊在Cell bioscience（IF 7.133）期刊發(fā)表題為Single-cell transcriptomic analysis of endometriosis provides insights into fibroblast fates and immune cell heterogeneity的研究結(jié)果，揭示了子宮內(nèi)膜異位癥病因和病理特征。歐易生物提供了該項目單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗及測序相關(guān)工作。歡迎有意向開展單細(xì)胞測序研究的老師們向我們咨詢溝通單細(xì)胞相關(guān)問題。Adam等人通過使用具有低溫活性的蛋白酶，對小鼠腎臟組織進(jìn)行單細(xì)胞測序，結(jié)果證明了在6℃條件下進(jìn)行解離。廣西推薦單細(xì)胞測序
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細(xì)胞 RNA 含量很少，擴(kuò)增和捕獲效率的微小變化，就可能在細(xì)胞間產(chǎn)生與生物學(xué)無關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本，可能會因為純粹的技術(shù)原因而不盡相同，矯正和過矯正也仍是數(shù)據(jù)處理中非常棘手的一件事情。動輒幾萬的成本在一定程度上限制了單細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)用。當(dāng)前主流的技術(shù)還是以國外技術(shù)為主，不過隨著國內(nèi)單細(xì)胞儀器公司的研發(fā)推進(jìn)，在不久的將來，單細(xì)胞測序的價格一定會有大幅的下降，會讓更多的科研工作者使用到單細(xì)胞技術(shù)，推動生命科學(xué)研究。貴州單細(xì)胞測序服務(wù)電話單細(xì)胞測序技術(shù)業(yè)已成為生命科學(xué)研究的基礎(chǔ)技術(shù)手段，為人們理解生命現(xiàn)象背后的機(jī)制提供了數(shù)據(jù)。
inferCNV 是一款 R 包，用來探索**單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中體細(xì)胞大規(guī)模染色體拷貝數(shù)變異，例如整個染色體或大片段染色體的擴(kuò)增（gain）或缺失（loss）。通過與一組參考的“正常”細(xì)胞比較，探索**基因組不同位置的基因表達(dá)強(qiáng)度來實(shí)現(xiàn)。通過熱圖顯示每條染色體上的相對表達(dá)強(qiáng)度，在以正常細(xì)胞作為參考的情況下可以直觀地判斷**基因組上的哪些區(qū)域是過表達(dá)和低表達(dá)。為了提高推斷結(jié)果的可靠性，inferCNV 采用幾種 residual expression 過濾方法減少數(shù)據(jù)中噪聲信號，從而發(fā)現(xiàn)真正的 CNV 的信號。
2021 年 1 月，山東大學(xué)齊魯醫(yī)院泌尿外科李巖老師發(fā)表了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜和上皮亞群分化特征的相關(guān)成果，文章的 10x Genomics 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒灪头治龉ぷ饔蓺W易生物提供。該研究對小鼠的膀胱上皮進(jìn)行了高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，繪制了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜，發(fā)現(xiàn)了一種可能與宿主反應(yīng)和傷口愈合有關(guān)的新型 Plxna4+ 膀胱尿路上皮細(xì)胞，以及一群由 ASPM 標(biāo)記的基底樣細(xì)胞，可能是膀胱尿路上皮祖細(xì)胞。通過 SCENIC 分析確定了調(diào)控尿路上皮細(xì)胞分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子，發(fā)現(xiàn)了膀胱疾病相關(guān)調(diào)控基因在不同尿路上皮細(xì)胞亞群中存在差異表達(dá)。該研究解析了小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞的特征，為膀胱尿路上皮和膀胱疾病的相關(guān)研究提供生物學(xué)基礎(chǔ)。10.目前認(rèn)知下的制備單細(xì)胞懸液需要將組織置于37℃保溫，以便蛋白酶發(fā)揮作用。
歐易生物是國內(nèi)早期開展單細(xì)胞測序分析的公司之一。目前擁有10x Genomics及BD Rhapsody兩個單細(xì)胞測序平臺，以及完整、系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析技術(shù)和流程。除了能夠進(jìn)行常規(guī)的scRNA-seq（single-cell RNA sequencing），還能夠進(jìn)行凍存樣本的snRNA-seq（single-nucleus RNA sequencing），為各種類型生物樣本進(jìn)行單細(xì)胞測序提供了系統(tǒng)、完整的解決方案。竭誠為廣大制藥行業(yè)客戶提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測序服務(wù)，助力您加快藥物研發(fā)進(jìn)程、降低臨床試驗風(fēng)險、節(jié)約研發(fā)成本。歡迎有意向開展單細(xì)胞測序研究的老師們向我們咨詢溝通單細(xì)胞相關(guān)問題 。我們將持續(xù)加大單細(xì)胞測序相關(guān)的研發(fā)投入，從樣本的處理優(yōu)化到多組合標(biāo)簽技術(shù)的開發(fā)應(yīng)用等。浙江項目單細(xì)胞測序
單細(xì)胞技術(shù)光明的前景也催生了國內(nèi)諸多科技創(chuàng)新型企業(yè)角逐單細(xì)胞市場。廣西推薦單細(xì)胞測序
在這個飛速發(fā)展的測序時代，DNA和RNA測序已經(jīng)逐漸成為“實(shí)驗室中的家常菜”。若要評選出目前很受歡迎的一道菜，那恐怕非單細(xì)胞RNA測序莫屬。以往，研究人員通常利用RNA測序（RNA-seq）來檢測樣本中的所有RNA轉(zhuǎn)錄本，以發(fā)現(xiàn)新型RNA，或開展基因表達(dá)分析。不過，測序的對象往往是組織樣本或細(xì)胞群，這使得細(xì)胞之間的差異有可能被平均值所掩蓋。自2013年被《Nature Methods》評為年度技術(shù)以來，這項技術(shù)正被迅速地采用，發(fā)表文獻(xiàn)的數(shù)量也在逐年遞增。廣西推薦單細(xì)胞測序
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