福建蛋白組學(xué)方法

來源: 發(fā)布時間:2022-09-19

TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究案例:2021年11月,南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位(一作劉史佳研究員)及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果,通過TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)和GC-MS非靶代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎?。―KD)特征,篩選了蛋白和代謝組合生物標(biāo)志物。為優(yōu)化糖尿病腎病(DKD)管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標(biāo)題:血清綜合組學(xué)揭示人類糖尿病腎病情況研究對象:人血清發(fā)表期刊:MolecularMetabolism影響因子:7.422發(fā)表時間:2021年11月1日合作單位:江蘇省中醫(yī)院運用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。福建蛋白組學(xué)方法

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(約16.9%)在正常組和對照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個下調(diào),1548個上調(diào)),560個基因(430個下調(diào),130個上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個上調(diào),121個下調(diào)),AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個上調(diào),95個下調(diào))。福建蛋白組學(xué)檢測價格蛋白組學(xué)檢測一個樣多少錢。

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法:2021年4月,南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法,分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢,確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。

本文為了探究其潛在的分子機制,作者運用RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué),對不同成熟度水平的油脂種子進(jìn)行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達(dá),而且為該樹種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標(biāo)題:基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象:油茶種子發(fā)表期刊:HorticultureResearch影響因子:6.793發(fā)表時間:2021.07.01發(fā)表單位:海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運用生物技術(shù):RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持蛋白質(zhì)組學(xué) 找歐易生物-生物標(biāo)志物、機制研究一站式服務(wù)。

蛋白組學(xué)研究案例:2022年1月,歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了肉桂酸(AC)和肉桂醛(AL)在改善葡萄糖脂代謝中的特征,探究了其代謝作用機理。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué) 。浙江蛋白組學(xué)平臺建設(shè)

歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。福建蛋白組學(xué)方法

蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點。基因組確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊列相比,本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細(xì)胞周期通路的上調(diào)以及細(xì)胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進(jìn)一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)(圖1F和1G)。福建蛋白組學(xué)方法

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