上海修飾蛋白組學(xué)

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，F(xiàn)ASN和SCD1）表達(dá)的趨勢，同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比，AC***增加了PEPCK的表達(dá)，兩種化學(xué)物質(zhì)對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致，這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)（圖4B）。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調(diào)，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。上海修飾蛋白組學(xué)

蛋白組學(xué)研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機(jī)理。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。天津差異蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。

蛋白組學(xué)研究實(shí)用案例：東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長劉必成教授領(lǐng)導(dǎo)的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通過蛋白組學(xué)+多層組學(xué)研究方法，建立IL-10細(xì)胞囊泡高表達(dá)模型的構(gòu)建，提出并驗(yàn)證了IL-10細(xì)胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說，探究了IL-10細(xì)胞外囊泡作為新型納米藥物的機(jī)理。中文標(biāo)題：細(xì)胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向：新藥研發(fā)及其機(jī)制研究發(fā)表期刊：Scienceadvances影響因子：14.136發(fā)表單位：中國南京東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院腎內(nèi)科運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS/MS蛋白組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）

作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題：氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發(fā)表時間：2021年9月1日發(fā)表單位：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù)：TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。蛋白組學(xué)專業(yè)客服在線為您答疑 。

TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)和GC-MS非靶代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎病（DKD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標(biāo)志物。為優(yōu)化糖尿病腎?。―KD）管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標(biāo)題：血清綜合組學(xué)揭示人類糖尿病腎病情況研究對象：人血清發(fā)表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發(fā)表時間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA蛋白質(zhì)組學(xué) 找歐易生物-生物標(biāo)志物、機(jī)制研究一站式服務(wù)。吉林蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)生信分析

蛋白質(zhì)組學(xué)基本策略 研究基礎(chǔ) 研究內(nèi)容 研究意義背景。上海修飾蛋白組學(xué)

通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因，包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時序分析表明，HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān)，增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力，因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述，結(jié)果證實(shí)了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的功能改變。上海修飾蛋白組學(xué)

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