遼寧空間代謝組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-04-04

空間代謝組學(xué)研究作者對P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過RNA測序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成??臻g代謝組三個(gè)維度的分析。遼寧空間代謝組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組

空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細(xì)胞增殖、凋亡、分化等多種細(xì)胞生物學(xué)過程中發(fā)揮作用,其易位、擴(kuò)增或表達(dá)異常常與多種**的發(fā)***展有關(guān)。近年來關(guān)于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多,據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關(guān)酶密切相關(guān);致*基因MYC刺激細(xì)胞生長需要脂質(zhì)來組裝新的細(xì)胞膜,但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導(dǎo)的**中脂質(zhì)生成的機(jī)制。重慶空間代謝組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組歐易生物空間代謝組學(xué)適合整體方案,助力科研,。

以上結(jié)果表明,AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物,并具有高特異性,能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡(luò)圖要了解大腦的結(jié)構(gòu)區(qū)域發(fā)生的復(fù)雜代謝過程,不僅應(yīng)準(zhǔn)確表征代謝物,還要研究其相關(guān)性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進(jìn)行代謝網(wǎng)絡(luò)重建。從15個(gè)微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進(jìn)行峰挑選和峰對齊(圖1F),包括松果體、中腦導(dǎo)水管、腦橋、梨狀皮質(zhì)、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。

空間代謝組學(xué):食道腺*是全球第八大崔常見的惡性**發(fā)病率正在持續(xù)上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具來提高早期診斷和精確***。脂質(zhì)代謝紊亂與**的發(fā)***展密切相關(guān),大多數(shù)脂質(zhì)以甘油磷脂(GPLs)的形式儲(chǔ)存在雙分子膜中,基于甘油磷脂具有較穩(wěn)定的物理化學(xué)性質(zhì),因此將其作為疾病診斷的生物標(biāo)志物具有重要意義。質(zhì)譜成像(MSI)可在幾分鐘內(nèi)對冷凍切片組織的**磷脂體量化并進(jìn)行客觀診斷。然而,MSI是否能客觀識(shí)別原發(fā)性食管腺*目前尚不清楚,這是一個(gè)重大的挑戰(zhàn),因?yàn)樵撐h(huán)境復(fù)雜,組織類型的表型相似。空間代謝組學(xué) 技術(shù)咨詢中心。

空間代謝組學(xué):質(zhì)譜成像技術(shù)近二十年來,隨著質(zhì)譜離子化技術(shù)的不斷發(fā)展,質(zhì)譜成像技術(shù)因其能夠直觀、快速、簡便地呈現(xiàn)出分子在細(xì)胞或組織中的結(jié)構(gòu)、空間與時(shí)間分布等信息,越來越受到大家的關(guān)注。并且質(zhì)譜成像技術(shù)也被***的用在**疾病研究、藥物前期發(fā)現(xiàn)等各領(lǐng)域的高質(zhì)量文章中,為生物標(biāo)志物的高靈敏度探測和藥物代謝精確成像研究奠定了基礎(chǔ),下面進(jìn)入到質(zhì)譜“畫”時(shí)代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“靈魂”3問,首先需要了解他們之間的關(guān)系。質(zhì)譜是通過采集化合物的質(zhì)荷比,獲得定性和定量的信息,進(jìn)而去探究物質(zhì)本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”這兩個(gè)根本性問題?!犊臻g代謝組科研應(yīng)用手冊》是一本集聚空間代謝組學(xué)的由來、發(fā)展、原理及應(yīng)用的科研專業(yè)讀物。貴州空間代謝組學(xué)翻譯

質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)方法及其應(yīng)用研究進(jìn)展。遼寧空間代謝組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組

空間代謝組學(xué)研究:一區(qū) | IF:14.553多發(fā)性硬化癥的相關(guān)空間代謝組學(xué)研究。本文為倫敦帝國理工學(xué)院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發(fā)表的題為“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果,通過拉曼+空間代謝組學(xué)+IHC研究方法,發(fā)現(xiàn)了新形成的髓鞘與正常髓鞘具有不同的脂質(zhì)成分,探究了多發(fā)性硬化中再髓鞘化形成的機(jī)理,描繪了用于關(guān)聯(lián)生物分子結(jié)構(gòu)和髓鞘成分的分子成像圖譜,為評估再髓鞘化***提供新策略。遼寧空間代謝組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組

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