Recombinant Cynomolgus CX3CL1/Fractalkine Protein

核酸內(nèi)切酶VIII（EndonucleaseVIII）是一種來(lái)自大腸桿菌的DNA損傷修復(fù)酶，具有以下特點(diǎn)：1.**雙功能活性**：核酸內(nèi)切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**釋放受損嘧啶堿基**：N-糖基化酶活性可以釋放雙鏈DNA上受損的嘧啶堿基，如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇，生成一個(gè)脫嘌呤(apurinic,AP)位點(diǎn)。3.**切割A(yù)P位點(diǎn)**：AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端，產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。4.**識(shí)別并切除受損堿基**：核酸內(nèi)切酶VIII可以識(shí)別并切除多種受損堿基，包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲。5.**與EndonucleaseIII的區(qū)別**：雖然核酸內(nèi)切酶VIII與核酸內(nèi)切酶III相似，但核酸內(nèi)切酶VIII具有β和δ裂解酶活性，而核酸內(nèi)切酶III具有β裂解酶活性。6.**應(yīng)用領(lǐng)域**：核酸內(nèi)切酶VIII可以應(yīng)用于單細(xì)胞凝膠電泳、NGS建庫(kù)中DNA損傷修復(fù)、酶法合成DNA中釋放DNA鏈、堿洗脫，搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)進(jìn)行含U片段的克隆等。

EndoH糖苷內(nèi)切酶H（EndoH）在實(shí)驗(yàn)中通常用于分析以下類型的糖鏈：1.**高甘露糖型糖鏈**：EndoH能夠特異性地識(shí)別并切割高甘露糖型N-連接糖鏈，這些糖鏈通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**某些雜合型糖鏈**：EndoH也能對(duì)某些雜合型寡聚糖的殼二糖結(jié)構(gòu)進(jìn)行切割，去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖。3.**N-連接糖鏈**：EndoH主要用于去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖，這有助于研究糖鏈結(jié)構(gòu)和糖基化模式。4.**抗體糖型分析**：在IgG中，F(xiàn)c區(qū)Asn297處的保守N-連接糖對(duì)其活性至關(guān)重要，EndoH可用于分析這些糖鏈。5.**糖蛋白的糖基化模式**：EndoH有助于分析糖蛋白的糖基化位點(diǎn)、糖基化程度以及糖鏈的具體結(jié)構(gòu)。6.**糖鏈分析和結(jié)構(gòu)表征**：在糖鏈分析的主要策略中，EndoH作為高效、準(zhǔn)確、穩(wěn)定的去糖基化方法，有助于從糖蛋白上游離糖鏈，然后進(jìn)行詳細(xì)的分析表征。EndoH的使用可以為研究者提供關(guān)于糖蛋白糖基化模式的重要信息，尤其是在抗體藥物研究和開(kāi)發(fā)中，對(duì)于理解糖鏈如何影響藥物的活性、穩(wěn)定性和免疫原性具有重要意義。

質(zhì)粒DNA提取后的儲(chǔ)存條件對(duì)于保持其活性至關(guān)重要。以下是一些推薦的儲(chǔ)存方法：1.**干燥保存**：質(zhì)粒DNA以干粉狀態(tài)保存是比較好的方法。如果總DNA以溶液形式保存，可以使用1×TE緩沖液稀釋，且TE緩沖液的pH值應(yīng)為8.0-8.5之間。2.**低溫保存**：植物總DNA低溫保存比較好在-80℃以下或液氮保存。如果沒(méi)有條件，也可以在-20℃保存。總DNA應(yīng)避免經(jīng)常凍融，同時(shí)建議每份樣品保存3-5個(gè)樣本?？侱NA提取后保存的時(shí)限通常較組織要長(zhǎng)（＞兩年），但若長(zhǎng)期保存，每隔兩年應(yīng)抽測(cè)，對(duì)不符合使用要求的DNA進(jìn)行更新。3.**避免反復(fù)凍融**：反復(fù)凍融會(huì)破壞DNA的完整性和活性，因此應(yīng)盡量避免。4.**使用保護(hù)劑**：化學(xué)添加劑如二甲基亞砜(DMSO)可以防止DNA單鏈斷裂，但因其毒性和使用量的問(wèn)題，并不是理想的保護(hù)劑。5.**封裝技術(shù)**：通過(guò)封裝技術(shù)保存DNA，可以隔絕外界水、氧氣和光等可能影響DNA穩(wěn)定的因素。例如，DNAshell®技術(shù)基于密封的不銹鋼微型膠囊，在惰性氣氛下，給予DNA干粉保護(hù)。6.**使用穩(wěn)定劑**：一些天然的雙糖，如海藻糖，被認(rèn)為是一種多功能的保護(hù)劑，可以保護(hù)生物體免受冷凍、加熱等不利條件的影響。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）與細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的主要區(qū)別如下：1.**來(lái)源不同**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I來(lái)源于牛痘病毒，是一種真核生物病毒中的酶。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶則來(lái)源于原核生物，如大腸桿菌的ω蛋白等。2.**功能特性**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能夠解旋DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)，并且識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT]，與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物，遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后，重新連接形成完整DNA鏈。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶，如大腸桿菌的ω蛋白，主要功能是催化DNA鏈斷開(kāi)和結(jié)合的偶聯(lián)反應(yīng)，以改變DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。3.**活性條件**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I即使在Mg2+不存在的條件下也顯示活性。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶可能需要Mg2+等金屬離子作為輔因子來(lái)發(fā)揮活性。4.**作用的DNA鏈**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能使正負(fù)兩方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由來(lái)的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I只作用負(fù)鏈的超螺旋分子。5.**共價(jià)鍵形成**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I與DNA形成共價(jià)連接，此酯鍵中所貯存的能量可能在切斷端的再結(jié)合上起著作用。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶在原核生物中是游離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與酶形成共價(jià)鍵。

FnCas12a系統(tǒng)的脫靶效應(yīng)較低，這對(duì)于減少非目標(biāo)效應(yīng)和提高物質(zhì)的安全性至關(guān)重要。

為了確保PCR實(shí)驗(yàn)中BstDNAPolymeraseI的活性比較大化，以下是一些關(guān)鍵的優(yōu)化措施：1.**反應(yīng)緩沖液**：使用適合BstDNAPolymeraseI的反應(yīng)緩沖液，如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack，該緩沖液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20，pH值為8.8，專為等溫?cái)U(kuò)增設(shè)計(jì)。2.**反應(yīng)條件**：BstDNAPolymeraseI的比較好反應(yīng)溫度通常在65°C左右。確保PCR儀能夠精確控制并保持這一溫度，以保證酶的活性和穩(wěn)定性。3.**酶的濃度**：根據(jù)反應(yīng)體系的需要調(diào)整BstDNAPolymeraseI的用量。過(guò)多的酶可能導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增，而過(guò)少則可能降低擴(kuò)增效率。通常，一個(gè)單位的酶能夠在65°C下，30分鐘內(nèi)將25nmol的dNTP摻入酸不溶性物質(zhì)。4.**Mg2+濃度**：Mg2+是DNA聚合酶活性的關(guān)鍵輔因子。其濃度對(duì)PCR反應(yīng)有影響，需要根據(jù)具體情況調(diào)整Mg2+濃度，以獲得比較好的擴(kuò)增效果。5.**dNTPs濃度**：dNTPs是DNA合成的基礎(chǔ)原料，其濃度約為200-300μM較為適宜。過(guò)高會(huì)增加非特異性擴(kuò)增。6.**引物設(shè)計(jì)**：設(shè)計(jì)特異性引物，通常長(zhǎng)度為18-30個(gè)堿基，Tm（熔解溫度）相近，以保證同時(shí)退火。7.**模板DNA的質(zhì)量和純度**：確保模板DNA無(wú)蛋白質(zhì)、RNA和其他雜質(zhì)的污染，這些雜質(zhì)可能會(huì)抑制酶的活性。研究表明，優(yōu)化后的Cas12a系統(tǒng)在多種細(xì)胞類型中表現(xiàn)出良好的編輯效率。SV40 T-Ag-derived NLS peptide

CRISPR-Cas12a（以前稱為Cpf1）是一種類II型V型內(nèi)切酶，偏好富含胸腺嘧啶的原間隔短回文重復(fù)序列鄰近基序。Recombinant Cynomolgus CX3CL1/Fractalkine Protein,His Tag

T5核酸外切酶（T5Exonuclease）具有以下特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用：1.**降解方向**：T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**：T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化，也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對(duì)超螺旋雙鏈DNA的作用**：T5核酸外切酶無(wú)法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**：T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**：-用于Gibson組裝，這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個(gè)重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA，增加超螺旋DNA比例，提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**：推薦在37℃溫育30分鐘，之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應(yīng)。7.**儲(chǔ)存條件**：-25～-15℃保存，有效期3年。8.**注意事項(xiàng)**：避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作，以防止本品失活。這些特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用使得T5核酸外切酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中，尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中，具有重要的應(yīng)用價(jià)值。Recombinant Cynomolgus CX3CL1/Fractalkine Protein,His Tag