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miRNA加尾法及其逆轉錄是近年來普遍用于miRNA研究的一種技術。它可以幫助我們深入理解miRNA的調控機制,它質量得到改進,效率也得到提高從而為miRNA研究提供了非常重要的資源。未來,miRNA加尾法及其逆轉錄一定會成為miRNA研究的重要部分,為miRNA研究提供更多有價值的信息。逆轉錄是一種重要的生物學現(xiàn)象,它在病毒的復制過程中發(fā)揮著重要的作用。同時,逆轉錄還可以作為基因的調節(jié)機制,從而控制基因的表達和功能。我們相信,在未來的研究中,逆轉錄的研究將會取得更多的進展,并且會為治著某些疾病提供更多的幫助。逆轉錄是2代測序、單細胞測序等技術的前置步驟。石家莊莖環(huán)法逆轉錄試劑
逆轉錄酶是存在于RNA病毒體內的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實驗中的逆轉錄酶需要具有以下二種活性:依賴RNA的DNA聚合酶活性:以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性:以一條DNA鏈為模板合成互補的雙鏈DNA。在選擇逆轉錄酶時,建議選擇無RNaseH①活性(RNaseH-)的逆轉錄酶。具有RNaseH活性的逆轉錄酶的RNaseH活性會與聚合酶活性競爭RNA模板與DNA引物(或cDNA延伸鏈)形成的雜合鏈,并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的產(chǎn)量與長度。上海彩色反轉錄生產(chǎn)商實時熒光PCR檢測需要經(jīng)過逆轉錄反應。
逆轉錄的過程:生物體中的逆轉錄過程就比較復雜,比如逆轉錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結構,充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發(fā)酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結構。
逆轉錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。逆轉錄過程由逆轉錄酶催化,此酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶,即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。
反轉錄酶的用處:由它催化轉錄合成的DNA稱為互補DNA(cDNA)。通常情況下,細胞內的轉錄應由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實現(xiàn)自身擴增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉錄合成cDNA再由cDNA轉錄出RNA。逆轉錄酶可用RT—PCR,將RNA轉變?yōu)镈NA后擴增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了反轉錄酶,并認為此酶與病毒的致死性質有關。反轉錄酶也分布于某些正常細胞和胚胎細胞。反轉錄酶的發(fā)現(xiàn)表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質非常化,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進了分子生物學、生物化學和病毒學的研究,已成為研究這些學科的有力工具。逆轉錄實驗中引物設計時要注意反向引物特異性和長度,避免循環(huán)擴增和特異性問題。石家莊莖環(huán)法逆轉錄試劑
逆轉錄過程中的缺陷會導致錯誤擴增和偏差。石家莊莖環(huán)法逆轉錄試劑
逆轉錄實驗步驟:用SSⅢ逆轉錄酶進行RT(20ul體積)1、準備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進行逆轉錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉錄酶。8、-20℃保存,或立即進行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉錄本的各個區(qū)域起始,并具有相同的逆轉錄效率,較大程度保證qPCR結果的真實性和可重復性。石家莊莖環(huán)法逆轉錄試劑