miRNA加尾法及其逆轉(zhuǎn)錄是近年來(lái)普遍用于miRNA研究的一種技術(shù)。它可以幫助我們深入理解miRNA的調(diào)控機(jī)制,它質(zhì)量得到改進(jìn),效率也得到提高從而為miRNA研究提供了非常重要的資源。未來(lái),miRNA加尾法及其逆轉(zhuǎn)錄一定會(huì)成為miRNA研究的重要部分,為miRNA研究提供更多有價(jià)值的信息。逆轉(zhuǎn)錄是一種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它在病毒的復(fù)制過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。同時(shí),逆轉(zhuǎn)錄還可以作為基因的調(diào)節(jié)機(jī)制,從而控制基因的表達(dá)和功能。我們相信,在未來(lái)的研究中,逆轉(zhuǎn)錄的研究將會(huì)取得更多的進(jìn)展,并且會(huì)為治著某些疾病提供更多的幫助。逆轉(zhuǎn)錄PCR在檢測(cè)病毒、診斷疾病等方面有普遍應(yīng)用。杭州快速逆轉(zhuǎn)錄試劑哪家好
逆轉(zhuǎn)錄時(shí)試劑沒(méi)混勻會(huì)怎么樣?會(huì)出現(xiàn)起泡現(xiàn)象。RT-PCR的試劑都應(yīng)在冰上融化,等完全融化后再取;用過(guò)的試劑應(yīng)瞬間離心后放回-20℃保存;試劑應(yīng)按順序加,加完后再混勻離心。使用ReverTra-Ace、RNase-Inhibitor等酶類時(shí),沒(méi)有混勻,會(huì)出現(xiàn)起泡現(xiàn)象;由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取時(shí)應(yīng)慢慢吸取。miRNA的RT-PCR:1)引物稀釋:miRNARTPrimer儲(chǔ)存液濃度:10μM。miRNARTPrimer工作液濃度:2μM。RTPrimer工作液配置:5μLRT-primer儲(chǔ)存液+45μLDEPC水。miRNA前后引物的工作液(10μM)用儲(chǔ)存液(100μM)稀釋后分裝,放入-20℃冰箱保存,避免反復(fù)凍融。杭州快速逆轉(zhuǎn)錄試劑哪家好逆轉(zhuǎn)錄也可作為RNA表達(dá)譜的分析方法。
大多數(shù)逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過(guò)程。此酶需要RNA為引物,多為賴氨酸的tRNA,在引物tRNA3'-末端以5'→3'方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此沒(méi)有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高。②RNaseH活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5'端水解掉RNA分子。③DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以反轉(zhuǎn)錄合成的首先條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子。
RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄引物設(shè)計(jì)原則:1.上下游引物要保守:擴(kuò)增子長(zhǎng)度需選擇一段保守片段(100-200bp)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,選擇片段需跨越內(nèi)含子,因內(nèi)含子的基因組DNA序列不會(huì)被擴(kuò)增,也可減少?gòu)奈廴镜幕蚪MDNA中擴(kuò)增得到的假陽(yáng)性風(fēng)險(xiǎn)。引物選取同樣需要保守。2.引物長(zhǎng)度和Tm值:引物設(shè)計(jì)長(zhǎng)度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設(shè)計(jì)引物時(shí)盡量避免出現(xiàn)4個(gè)或超過(guò)4個(gè)G堿基。RT-PCR實(shí)驗(yàn)陰性對(duì)照:反轉(zhuǎn)錄陰性對(duì)照應(yīng)包括在所有的RT-PCR的實(shí)驗(yàn)中,用來(lái)檢測(cè)DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產(chǎn)物)。該對(duì)照所指不加反轉(zhuǎn)錄酶,通過(guò)反轉(zhuǎn)錄過(guò)程得到cDNA在進(jìn)行熒光定量PCR檢測(cè)。如檢測(cè)到擴(kuò)增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。
RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄中模板的選擇:在RT-PCR實(shí)驗(yàn)中,選擇總RNA或純化的mRNA作為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄十分重要。mRNA雖然能提供略高的靈敏度,但總RNA經(jīng)常使用,具有較mRNA更重要的優(yōu)勢(shì)。首先,其過(guò)程需要較少的純化流程,這保證了更好的回收模板和更好的把結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)化為起始的細(xì)胞數(shù)。第二,避免mRNA富集步驟,為了避免不同mRNA的回收率而帶來(lái)結(jié)果偏移的可能性??傊?,在大多數(shù)的應(yīng)用中,目標(biāo)基因的相對(duì)定量比檢測(cè)的非常靈敏度更重要,因此在多數(shù)情況下,總RNA更適用。逆轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)機(jī)理是RNA模板上的DNA合成。杭州快速逆轉(zhuǎn)錄試劑哪家好
高效的逆轉(zhuǎn)錄體系可提高反應(yīng)效率和檢測(cè)靈敏度。杭州快速逆轉(zhuǎn)錄試劑哪家好
反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase,也可寫成逆轉(zhuǎn)錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了一種特殊的DNA聚合酶,該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-OH末端上,根據(jù)堿基配對(duì)的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補(bǔ)的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補(bǔ)DNA(complementaryDNA,CDNA)。反轉(zhuǎn)錄酶(Reversetranscriptase)是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補(bǔ)DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥(niǎo)類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。杭州快速逆轉(zhuǎn)錄試劑哪家好