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逆轉(zhuǎn)錄的過程:生物體中的逆轉(zhuǎn)錄過程就比較復(fù)雜,比如逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風(fēng)”,所有東西都?jí)嚎s到非常。比如它的基因組中,經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結(jié)構(gòu),充分利用每一個(gè)堿基。所以它也不會(huì)專門編碼一個(gè)引發(fā)酶來合成引物,它一般是在組裝時(shí)帶走宿主的tRNA,在下次侵染時(shí)當(dāng)作引物使用。被用作引物的tRNA會(huì)結(jié)合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復(fù)序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄。之后水解RNA鏈的時(shí)候,會(huì)留下一些片段作為復(fù)制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(fù)(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時(shí)用來配對(duì)的序列,還有整合信號(hào)、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、polyA位點(diǎn)等重要結(jié)構(gòu)。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)首先需要逆轉(zhuǎn)錄酶的反應(yīng)活性。一體化逆轉(zhuǎn)錄混合芯片檢測(cè)
miRNA加尾法及其逆轉(zhuǎn)錄是近年來普遍用于miRNA研究的一種技術(shù)。它可以幫助我們深入理解miRNA的調(diào)控機(jī)制,它質(zhì)量得到改進(jìn),效率也得到提高從而為miRNA研究提供了非常重要的資源。未來,miRNA加尾法及其逆轉(zhuǎn)錄一定會(huì)成為miRNA研究的重要部分,為miRNA研究提供更多有價(jià)值的信息。逆轉(zhuǎn)錄是一種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它在病毒的復(fù)制過程中發(fā)揮著重要的作用。同時(shí),逆轉(zhuǎn)錄還可以作為基因的調(diào)節(jié)機(jī)制,從而控制基因的表達(dá)和功能。我們相信,在未來的研究中,逆轉(zhuǎn)錄的研究將會(huì)取得更多的進(jìn)展,并且會(huì)為治著某些疾病提供更多的幫助。一體化逆轉(zhuǎn)錄混合芯片檢測(cè)逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)反應(yīng)過程中需控制反應(yīng)溫度,時(shí)間和pH值等指標(biāo)。
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細(xì)胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動(dòng)作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細(xì)胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補(bǔ)的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補(bǔ)的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導(dǎo)的DNA合成過程。病毒復(fù)制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉(zhuǎn)錄酶的選擇,逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前要對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對(duì)照。多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高。②RNaseH活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。
RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反轉(zhuǎn)錄之前還需要對(duì)RNA濃度進(jìn)行測(cè)定。一般反轉(zhuǎn)錄試劑盒會(huì)對(duì)上樣量有要求,建議totalRNA上樣量小于5μg。超過這個(gè)范圍,會(huì)使反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物產(chǎn)生偏好性(表達(dá)豐度高的基因優(yōu)先被反轉(zhuǎn)錄)而造成定量結(jié)果不準(zhǔn)確。逆轉(zhuǎn)錄引物的選擇:逆轉(zhuǎn)錄引物一般包含3種:oligodT引物,隨機(jī)引物和特異性引物。對(duì)于短的且不具備發(fā)卡結(jié)構(gòu)的真核細(xì)胞mRNA,三種都可用。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。逆轉(zhuǎn)錄可改變RNA的信息內(nèi)容,為研究RNA功能提供基礎(chǔ)。北京彩色逆轉(zhuǎn)錄酶報(bào)價(jià)表
逆轉(zhuǎn)錄PCR是較常用的逆轉(zhuǎn)錄應(yīng)用之一。一體化逆轉(zhuǎn)錄混合芯片檢測(cè)
逆轉(zhuǎn)錄酶的質(zhì)量控制:1.切口酶:在與200單位酶37oC保溫60分鐘后,超螺旋質(zhì)粒保留在90%以上。2.DNase測(cè)定:200單位酶與50ng3H-DNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于1%。3.RNase測(cè)定:200單位酶與50ng3H-RNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于3%。4.首先鏈cDNA的反應(yīng):在標(biāo)準(zhǔn)化的反應(yīng)中,200單位酶催化從1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA將同位素?fù)饺氲絚DNA中,通過放射自顯影,對(duì)于1.2kb的RNA,產(chǎn)物cDNA是單一的、全長的條帶。對(duì)于7.5kb的RNA產(chǎn)物有部分是全長的條帶。用這二種RNA放射性轉(zhuǎn)換到cDNA中有12%。5.RNaseH活性:200單位酶與polyA:polydT37oC保溫60分鐘,釋放出的放射性要低于1%。一體化逆轉(zhuǎn)錄混合芯片檢測(cè)