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RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄中模板的選擇:在RT-PCR實(shí)驗(yàn)中,選擇總RNA或純化的mRNA作為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄十分重要。mRNA雖然能提供略高的靈敏度,但總RNA經(jīng)常使用,具有較mRNA更重要的優(yōu)勢(shì)。首先,其過(guò)程需要較少的純化流程,這保證了更好的回收模板和更好的把結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)化為起始的細(xì)胞數(shù)。第二,避免mRNA富集步驟,為了避免不同mRNA的回收率而帶來(lái)結(jié)果偏移的可能性??傊?,在大多數(shù)的應(yīng)用中,目標(biāo)基因的相對(duì)定量比檢測(cè)的非常靈敏度更重要,因此在多數(shù)情況下,總RNA更適用。逆轉(zhuǎn)錄在病毒學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域有普遍的應(yīng)用。杭州加尾法逆轉(zhuǎn)錄純度高
反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項(xiàng),引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時(shí),要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長(zhǎng)鏈甚至全長(zhǎng)mRNA的RT,所以對(duì)RNA樣品的質(zhì)量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng),建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設(shè)計(jì)引物時(shí)的下游引物做RT,引物設(shè)計(jì)質(zhì)量影響RT的結(jié)果,而且不同引物退火溫度本來(lái)就不相同,所以按照說(shuō)明書按照一個(gè)溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。帶gDNA Remover逆轉(zhuǎn)錄酶芯片檢測(cè)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒。
逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒,DNA病毒中的擬逆轉(zhuǎn)錄病毒的復(fù)制均需要經(jīng)過(guò)逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程在真核細(xì)胞中也同樣存在,例如逆轉(zhuǎn)座子和端粒DNA的延長(zhǎng)均存在逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程,需逆轉(zhuǎn)錄酶的催化,端粒酶即為真核細(xì)胞中的逆轉(zhuǎn)錄酶。逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程的揭示是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn),是對(duì)中心法則的重要修正和補(bǔ)充。人們通過(guò)體外模擬該過(guò)程,以樣本中提取的mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補(bǔ)的cDNA,構(gòu)建cDNA文庫(kù),并從中篩選特異的目的基因。該方法已成為基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的策略之一。
RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反轉(zhuǎn)錄之前還需要對(duì)RNA濃度進(jìn)行測(cè)定。一般反轉(zhuǎn)錄試劑盒會(huì)對(duì)上樣量有要求,建議totalRNA上樣量小于5μg。超過(guò)這個(gè)范圍,會(huì)使反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物產(chǎn)生偏好性(表達(dá)豐度高的基因優(yōu)先被反轉(zhuǎn)錄)而造成定量結(jié)果不準(zhǔn)確。逆轉(zhuǎn)錄引物的選擇:逆轉(zhuǎn)錄引物一般包含3種:oligodT引物,隨機(jī)引物和特異性引物。對(duì)于短的且不具備發(fā)卡結(jié)構(gòu)的真核細(xì)胞mRNA,三種都可用。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)應(yīng)用于人類基因組的研究。
逆轉(zhuǎn)錄是指以RNA為模板合成DNA的過(guò)程,即將遺傳信息由RNA逆向傳給DNA的過(guò)程,其遺傳的傳遞方向與轉(zhuǎn)錄相反。反轉(zhuǎn)錄酶也可寫成逆轉(zhuǎn)錄酶又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補(bǔ)DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過(guò)程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒(méi)有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高。HIV病毒復(fù)制的一個(gè)重要步驟就是逆轉(zhuǎn)錄。蘇州miQP2逆轉(zhuǎn)錄混合哪家好
逆轉(zhuǎn)錄后的DNA可用于構(gòu)建基因工程載體。杭州加尾法逆轉(zhuǎn)錄純度高
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過(guò)程有所不同。一般來(lái)講,mRNA比較長(zhǎng),其長(zhǎng)度通常在幾百至幾千個(gè)核苷酸,因此使用隨機(jī)引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機(jī)結(jié)合到mRNA的各位置進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過(guò)程只需擴(kuò)增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機(jī)引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當(dāng)然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴(kuò)增cDNA全長(zhǎng)時(shí)是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。杭州加尾法逆轉(zhuǎn)錄純度高