成都單細(xì)胞BCR測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-02

免疫組庫(kù)測(cè)序有必要做嗎? 對(duì)于十的十二次方個(gè)以上的抗原識(shí)別基數(shù)來說,群體和個(gè)體間的免疫組庫(kù)的豐富程度能夠直接反應(yīng)機(jī)體免疫系統(tǒng)情況,通常TCR/BCR的亞型越多,機(jī)體識(shí)別病原的能力越強(qiáng),越不容易患病,但超過一定限度,也容易引發(fā)自身免疫性疾病。且機(jī)體的免疫組庫(kù)也不是一成不變的,會(huì)隨著年齡,環(huán)境,藥物,患病等等因素,免疫組庫(kù)多樣性也時(shí)刻處于動(dòng)態(tài)變化當(dāng)中。由此,將免疫組庫(kù)測(cè)序用于臨床診斷和診療上,有助于對(duì)群體或個(gè)體間進(jìn)行免疫監(jiān)測(cè),探究相關(guān)疾病和免疫應(yīng)答的關(guān)系,監(jiān)測(cè)免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制。單細(xì)胞測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。成都單細(xì)胞BCR測(cè)序

多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!深圳單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。

烈冰科技作為國(guó)內(nèi)同時(shí)擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),實(shí)測(cè)BD Rhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái)、建庫(kù)方法,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。

二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測(cè)序”(sequencing by synthesis)和大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)(massive parallel analysis,MPS),使測(cè)序通量和讀取速度得到極大提升,烈冰生物斥巨資購(gòu)置的Novaseq6000測(cè)序儀的測(cè)序原理可以簡(jiǎn)化為四步:樣品文庫(kù)構(gòu)建、簇生成、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長(zhǎng)限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,用于結(jié)合測(cè)序通道上的位點(diǎn);3)Primer binding site,用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務(wù)。

什么是染色質(zhì)可及性? 正常情況下,DNA與核小體纏繞折疊在一起形成染色質(zhì),但是DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄都是需要將染色體的高級(jí)結(jié)構(gòu)解開的,然而解壓并不需要將整個(gè)染色體全部打開,而只需要打開一部分,即需要表達(dá)基因的區(qū)域。這部分打開的染色質(zhì),就叫開放染色質(zhì)(open chromatin)。打開染色質(zhì),允許部分調(diào)控蛋白(比如轉(zhuǎn)錄因子和輔因子)過來與之相結(jié)合的特性,即染色質(zhì)的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing),即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可及性的高通量測(cè)序技術(shù),通俗來說就是將攜帶測(cè)序信息的轉(zhuǎn)座酶等插入開放性染色質(zhì)中進(jìn)行識(shí)別,進(jìn)一步通過高通量測(cè)序及生物信息學(xué)分析來挖掘相關(guān)基因信息,以探究生物學(xué)相關(guān)問題。與ScRNA-Seq類似,ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基礎(chǔ)上,解決不同細(xì)胞群體的異質(zhì)性的問題,檢出混雜樣品測(cè)序所無法得到的異質(zhì)性信息。烈冰開展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。廣州BD單細(xì)胞測(cè)序價(jià)格

烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。成都單細(xì)胞BCR測(cè)序

空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進(jìn)行分析,例如,利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時(shí)期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號(hào)通路及其關(guān)鍵基因的較大情況,揭示在特定發(fā)育時(shí)期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學(xué)過程。針對(duì)任何一個(gè)基因,空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達(dá)該基因的點(diǎn)陣及其空間排布;單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達(dá)的細(xì)胞類群;原位測(cè)序可以給出該基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)狀況。通過不同發(fā)育時(shí)間點(diǎn)的信息比較,可以分析細(xì)胞類群在某個(gè)部位在不同時(shí)間點(diǎn)的差異,給出其在細(xì)胞內(nèi)的真實(shí)的演變狀況。成都單細(xì)胞BCR測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營(yíng)品牌有NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,該公司服務(wù)型的公司。是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),隨著市場(chǎng)的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,與多家企業(yè)合作研究,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過不斷改進(jìn),追求新型,在強(qiáng)化內(nèi)部管理,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí),良好的質(zhì)量、合理的價(jià)格、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評(píng)。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。烈冰生物將以真誠(chéng)的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品,為彼此贏得全新的未來!