溫州BD單細(xì)胞測序多重?zé)晒饷庖呓M化

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-03

基于10X Geomics 動(dòng)態(tài)微流控技術(shù),利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),形成短片段,單細(xì)胞ATAC測序在表觀基因組學(xué)水平上,揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問題,區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性,獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的重要突破:分析每個(gè)細(xì)胞數(shù)千個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)開放區(qū)域,識(shí)別細(xì)胞類型和細(xì)胞狀態(tài);識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤;探究驅(qū)動(dòng)細(xì)胞類型和狀態(tài)之間基因表達(dá)差異的非編碼序列;探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當(dāng)前重要的多組學(xué)研究基因表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的手段。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。溫州BD單細(xì)胞測序多重?zé)晒饷庖呓M化

不同類型的細(xì)胞或者在不同的條件下,活細(xì)胞中染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)是在不斷變化的,比如說各種應(yīng)激反應(yīng)(stimulus response)和抗逆反應(yīng)(stress response)等,也就是說染色質(zhì)的可及性是會(huì)隨細(xì)胞類型和外界刺激的改變而發(fā)生變化,而染色質(zhì)開放區(qū)域的定向測序可以幫助我們了解細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程,確定開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控差異、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,確定哪些基因在細(xì)胞中具有轉(zhuǎn)錄活性。單細(xì)胞多組學(xué)測序是一種比較強(qiáng)大的表觀遺傳學(xué)研究工具,在開放染色質(zhì)圖譜繪制,細(xì)胞分化發(fā)育,疾病的致病機(jī)制,樣本微環(huán)境等方面具有極大的應(yīng)用前景。武漢BD VDJ測序服務(wù)烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測序”(sequencing by synthesis)和大規(guī)模平行測序技術(shù)(massive parallel analysis,MPS),使測序通量和讀取速度得到極大提升,烈冰生物斥巨資購置的Novaseq6000測序儀的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構(gòu)建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,用于結(jié)合測序通道上的位點(diǎn);3)Primer binding site,用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)。

所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與 傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù)。

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。烈冰生物成立于2010年,專注于單細(xì)胞測序領(lǐng)域科研服務(wù)。常州單細(xì)胞免疫組庫測序

強(qiáng)勢發(fā)文!烈冰單細(xì)胞測序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。溫州BD單細(xì)胞測序多重?zé)晒饷庖呓M化

基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴(kuò)增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時(shí)使用特殊標(biāo)記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團(tuán),用于區(qū)分ATCG;2)3'端使用疊氮基團(tuán)封閉,保證一次循環(huán)只上一個(gè)dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時(shí),會(huì)通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團(tuán)和疊氮基團(tuán),開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點(diǎn)的熒光,實(shí)時(shí)獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控,隨著循環(huán)數(shù)的增大會(huì)出現(xiàn)不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。溫州BD單細(xì)胞測序多重?zé)晒饷庖呓M化

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于閔行區(qū)新駿環(huán)路138號2幢2F,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè)。以滿足顧客要求為己任;以顧客永遠(yuǎn)滿意為標(biāo)準(zhǔn);以保持行業(yè)優(yōu)先為目標(biāo),提供***的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序。烈冰生物自成立以來,一直堅(jiān)持走正規(guī)化、專業(yè)化路線,得到了廣大客戶及社會(huì)各界的普遍認(rèn)可與大力支持。