單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽，需要對細胞數(shù)量、細胞活性進準判斷，這對Single Cell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計數(shù)偏低，則會提高雙細胞的比例；而細胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細胞懸液質量這一關尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式，來對應各種不同的操作。通過已經(jīng)設定的程序來控制液體的流速，大幅度降低人為操作習慣帶來的差異，保證實驗操作的一致性。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。上海10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞， 基于每個細胞分別建庫測序，獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型，可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較，反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺實現(xiàn)了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲，系統(tǒng)實現(xiàn)16個通道同時運行，每個通道可捕獲2000-20000個細胞（不混樣），并支持原Chromium Controller體統(tǒng)外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗，可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規(guī)模單細胞研究。淄博單細胞測序多組學測序豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務。
一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲，小心得不償失，原因在這：單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行，而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細胞基因表達譜，通過降維（pca），無監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個細胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當細胞捕獲數(shù)過多時，無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù)，都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時，數(shù)據(jù)量在100G左右時，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。
單細胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？ 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗，100+組織類型解離protocol，精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系，確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗，珍貴樣本無法使用？ 烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術，確保凍存組織使用。 珍貴樣本，細胞數(shù)量太少，消化背景雜無法做單細胞？ 采用國際認可的10X Genomics，BD Rhapsody雙平臺模式，根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少，背景雜也能做單細胞。 單細胞RNA分類精度不足，部分細胞無法細分？ 烈冰同時采用單細胞蛋白質組與單細胞轉錄組測序技術，真正做到從上游到下游的全流程檢測，確保超高的細胞分類精度。個性化制定測序項目方面，滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。
科研的魅力之處，在于無窮盡的探尋生命的本底，通過單細胞測序，我們對組織的分子基礎的研究也從初級到深層，并在單細胞層面逐漸達成一致，那么不禁要問一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質性是功能的關鍵特征，細胞的位置信息更能反應細胞命運調(diào)控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面，而不可否認的是，此時空間坐標的記錄，像一個還未長大的娃娃，雖未觸及分子基礎研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。附加流式分選細胞表面Marker，對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定，助力高要求測序項目。青島單細胞測序數(shù)據(jù)分析
單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型。上海10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
二代測序技術在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencing by synthesis）和大規(guī)模平行測序技術（massive parallel analysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如Illumina Solexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制，樣品DNA或由RNA逆轉錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3'和5'端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結合測序通道上的位點；3）Primer binding site，用于結合PCR引物啟動擴增反應。上海10X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，是一家服務型的公司。公司自成立以來，以質量為發(fā)展，讓匠心彌散在每個細節(jié)，公司旗下單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序深受客戶的喜愛。公司秉持誠信為本的經(jīng)營理念，在醫(yī)藥健康深耕多年，以技術為先導，以自主產(chǎn)品為重點，發(fā)揮人才優(yōu)勢，打造醫(yī)藥健康良好品牌。烈冰生物秉承“客戶為尊、服務為榮、創(chuàng)意為先、技術為實”的經(jīng)營理念，全力打造公司的重點競爭力。