陜西10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-06-13

10× Genomics官方建議,當單細胞懸液活性低于70%時應(yīng)做去除死細胞操作,并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec)。需要注意到,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細胞懸液含有多少細胞數(shù)量才建議做去除死細胞的操作。基于烈冰多年單細胞測序?qū)嶒灲?jīng)驗,建議當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài),失真嚴重,建議重新收集樣本進行新的實驗,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性。附加流式分選細胞表面Marker,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。陜西10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要?!睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn),科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。西安10X Genomics單細胞測序百萬通量平臺高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。

單細胞多組學帶來的突破 單細胞測序方法不但改進了實驗過程,還幫助科學家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認識。從鑒定新的細胞類型和狀態(tài),到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機制,單細胞測序正在推動突破性的研究,有望改變生物學和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學的未來,我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息,在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,獲得細胞/基因的空間表達特異性。個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。

科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,通過單細胞測序,我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層,并在單細胞層面逐漸達成一致,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,細胞的位置信息更能反應(yīng)細胞命運調(diào)控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面,而不可否認的是,此時空間坐標的記錄,像一個還未長大的娃娃,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務(wù)。西安二代測序單細胞測序服務(wù)

烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細胞測序新時代。陜西10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺

為什么需要單細胞分辨率? 生物學就像宇宙一樣。它非常復雜,有許多獨特的單體,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質(zhì)性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,闡明具體細節(jié),構(gòu)建出一幅更大、更精細的圖譜,說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復發(fā)?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。陜西10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺

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