機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經(jīng)歷轉錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。烈冰生物成立于2010年，專注于單細胞測序領域科研服務。南昌10X單細胞測序
烈冰生物搭建近10臺10XGemomics平臺，目前為全國范圍內的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學者提供鼓舞，10X微流體“雙十字”交叉系統(tǒng)為8或16通道系統(tǒng)，每個通道上限可捕獲20000細胞，16通道一次可檢測細胞范圍為百萬級別的細胞水平。此外，單個細胞捕獲效率高達65%，可準確鑒別稀有細胞類型，利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究；細胞可適性高，對細胞大小（直徑超過40um細胞需要制備成細胞核）及類型無限制。細胞捕獲周期較短，能夠實現(xiàn)自動分離，無需人工操作，1天內可完成從細胞懸液到cDNA文庫構建的所有的測序準備工作。吉林10X Chromium X單細胞測序多組學測序烈冰測序服務已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。
RNA測序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉錄組學方法作為一類強大的工具，可提供混合樣本的基因表達平均數(shù)據(jù)，幫助科學家開始揭示這種異質性。隨后，技術創(chuàng)新的飛躍在單細胞技術上達到新高度——使得科學家能夠定義細胞類型特異的基因表達，從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅動其表達模式的細胞異質性。這讓研究人員能夠更詳細地表征組織異質性，鑒定稀有細胞類型，并逐個細胞地仔細分析其分子機制。當獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實的圖譜后，研究人員就有了更為堅實可靠的知識基礎，并能在這個基礎上規(guī)劃下一步實驗，以獲取更深入的可行動見解。
關于單細胞測序實驗樣本制備，這與流式細胞術用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過酶促或機械消化、細胞分選或其他細胞分離技術從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液。隨后是細胞計數(shù)和質量控制步驟，以確保您的樣本有適當濃度的活細胞，并且不含細胞團塊和死細胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對樣本進行染色，標記細胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗目標而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質量、樣本豐度、細胞大小，以及是否需要提取出細胞核進行染色質可接近性分析。無論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個基本原則，那就是生成高質量的單細胞懸液。全線搭建10X Genomics Chromium X單細胞實驗測序平臺。
針對單細胞測序的細胞上樣數(shù)，為什么不建議捕獲到的細胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時，如果目標細胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000，上樣細胞懸液體積勢必增加，在細胞懸液質量不是很理想（細胞活性<90%、碎片率>5%、結團率均>5%）的情況下，引入的背景信號會增加，分析結果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當cell和non-cell無法有效區(qū)分時，會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結果！當目標細胞捕獲數(shù)很大時，多細胞率會增加，數(shù)據(jù)分析時，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍（N是一個GEM包裹的細胞數(shù)），導致所有細胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)（單個細胞基因檢測中位數(shù)、單個細胞UMI檢測中位數(shù)）虛高。此部分“cell”雖然可以通過設置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾，但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除！單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型。蘇州10X Chromium X單細胞測序多組學測序
烈冰引進國際主流單細胞和空間轉錄組測序平臺，保障細胞精度的前提下提供組織內部精細區(qū)域的空間信息。南昌10X單細胞測序
針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數(shù)量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少，導致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等，他們的基因表達數(shù)較高，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此，我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時，需要考察實際組織的細胞組成。南昌10X單細胞測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發(fā)、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業(yè)務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司，致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向導，為客戶提供***的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序。烈冰生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心，為用戶帶來良好體驗。烈冰生物始終關注自身，在風云變化的時代，對自身的建設毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。