單細胞多組學提升見解 基于測序的數據能夠將彰顯其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學提供了同一細節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10x Genomics Chromium單細胞平臺能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統方法不同,單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數據集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。烈冰單細胞測序,助力您的深入科學探究。福州單細胞測序平臺
相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題,10X平臺普遍提供的細胞數量都在1000-20000不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托Random Cell Label技術,使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設備存在的Index hooping現象,相對于Smart-Seq數據來說,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網站曾給出hooping測試結果,顯示無影響。上海二代測序單細胞測序數據分析烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,解碼生命本質。
單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術,突破傳統高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞, 基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài),并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺實現了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲,系統實現16個通道同時運行,每個通道可捕獲2000-20000個細胞(不混樣),并支持原Chromium Controller體統外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗,可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規(guī)模單細胞研究。
針對單細胞測序的細胞上樣數,為什么不建議捕獲到的細胞數量越高越好?一味地追求高數量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時,如果目標細胞捕獲數增加到8000甚至10000,上樣細胞懸液體積勢必增加,在細胞懸液質量不是很理想(細胞活性<90%、碎片率>5%、結團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結果不理想的直接體現包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當cell和non-cell無法有效區(qū)分時,會使得數據出現假陽性和假陰性結果!當目標細胞捕獲數很大時,多細胞率會增加,數據分析時,此部分“cell”表現為基因檢測數和UMI檢測數是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細胞數),導致所有細胞的統計數據(單個細胞基因檢測中位數、單個細胞UMI檢測中位數)虛高。此部分“cell”雖然可以通過設置數據分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數據的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除!助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力醫(yī)療健康時代!
所謂的高通量測序技術,又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號,獲取序列信息。與傳統測序法(Sanger法等)相比,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。單細胞測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。過去的十年,我們是知識的承載者;現在,我們在努力構建醫(yī)學的大數據時代;未來我們將重新定義知識形態(tài)!天津10X Chromium X單細胞測序
單細胞科聯合空間轉錄組,展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,揭示精細病理區(qū)域中“喚醒”的信號通路。福州單細胞測序平臺
烈冰生物成立于2010年,與時俱進,堅持為科研學者提供國際前沿的高通量測序實驗和深度的生物信息數據分析服務,已逐步發(fā)展為單細胞多組學檢測服務高新技術企業(yè)。專注于“單細胞測序系列技術服務”的專精領域,在上海、北京、廣州、西安和江西等地擁有數千平辦公場所,并布局多中心產品研發(fā)生產基地和營銷、運營中心。2016年起連續(xù)被評為上海市高新技術企業(yè),60+項自主知識產權,轉化率近80%。產品覆蓋從單細胞測序,核測序,單細胞多組學,空間轉錄組測序等多組學聯合的實驗+數據分析全流程服務平臺。為600+國內高校和醫(yī)院、5000+深度合作學者用戶、10000+生命科學探索的重要科研項目在醫(yī)藥開發(fā)、科學研究、醫(yī)學及臨床研究,疾病分子標志物篩選、生命和神經發(fā)育研究等提供多層次、多組學檢測服務和解決方案,助力300+CNS國際學術期刊文章發(fā)表,30+篇單細胞技術聯合(助力)發(fā)文,IF 10+文章占比>65%。福州單細胞測序平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務型的公司。烈冰生物致力于為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司注重以質量為中心,以服務為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。烈冰生物立足于全國市場,依托強大的研發(fā)實力,融合前沿的技術理念,飛快響應客戶的變化需求。