由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本,使得單細(xì)胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BD Rhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細(xì)胞月8700個讀數(shù))。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細(xì)胞的上樣條件下,每個細(xì)胞中,來自每個細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個細(xì)胞下小于5%。烈冰專注單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。scRNA單細(xì)胞平臺
從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。杭州scRNA單細(xì)胞多組學(xué)測序個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學(xué)測序要求。
烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。
烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng),可平行分析成千上萬個單細(xì)胞內(nèi)數(shù)千個基因的表達(dá)水平,單細(xì)胞RNA-seq正在改變我們對細(xì)胞的理解。而烈冰作為多平臺的技術(shù)服務(wù)提供商,基于BD 在生物學(xué)領(lǐng)域40年的專業(yè)技術(shù),滿足您的實驗需求,在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能。BD單細(xì)胞測序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性,如微陣列和大量細(xì)胞RNA-seq,這些技術(shù)檢測通過實現(xiàn)對各個細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,依賴于對多個細(xì)胞的平行檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細(xì)胞類型,其進一步幫助理解從免疫學(xué)到疾病發(fā)展的多個領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過程。烈冰對于一個細(xì)胞群體中的每個細(xì)胞單獨進行建庫測序分析。
為什么需要單細(xì)胞分辨率? 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜,有許多獨特的單體,也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性。單細(xì)胞測序能夠在以一個細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究,闡明具體細(xì)節(jié),構(gòu)建出一幅更大、更精細(xì)的圖譜,說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復(fù)發(fā)?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺?;茨螧D單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程BD單細(xì)胞測序服務(wù)。scRNA單細(xì)胞平臺
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,當(dāng)存在多個斜率拐點的時候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細(xì)胞數(shù)量進行過濾。當(dāng)斜率拐點低于UMI=500的時候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。scRNA單細(xì)胞平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全,辦公環(huán)境優(yōu)越,為員工打造良好的辦公環(huán)境。致力于創(chuàng)造高品質(zhì)的產(chǎn)品與服務(wù),以誠信、敬業(yè)、進取為宗旨,以建NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造產(chǎn)品為目標(biāo),努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè)。公司不僅僅提供專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】,同時還建立了完善的售后服務(wù)體系,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。誠實、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,也是我們做人的基本準(zhǔn)則。公司致力于打造高品質(zhì)的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序。