南京scRNA單細(xì)胞平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-07-12

單細(xì)胞測序?qū)嶒炘贅颖炯?xì)胞上機分選簽,需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進準(zhǔn)判斷,這對Single Cell分選標(biāo)記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計數(shù)偏高,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,則會提高雙細(xì)胞的比例;而細(xì)胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。南京scRNA單細(xì)胞平臺

相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,BD平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細(xì)胞量,特殊研究需求的項目,可提供上限40000個細(xì)胞的捕獲量(單個樣本)。這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對于基于基因表達(dá)進行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,都會更實用。此外針對特殊項目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,滿足您的實際需求。蘇州BD VDJ單細(xì)胞服務(wù)機構(gòu)單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型。

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),基于BD平臺從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺對實驗過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小,可在技術(shù)、生物學(xué)、實驗中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果,而磁珠的拆分使用和即時存儲,可增加實驗設(shè)計的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控,從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測,到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,均實現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控,讓您的每個樣本在實驗端全程無憂。

烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù),為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),保證每次實驗的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進行質(zhì)量控制,如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率(雙細(xì)胞率)。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量,并確認(rèn)微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態(tài) ;在細(xì)胞裂解前的步驟中評估細(xì)胞活性;并對通過測序確定的細(xì)胞回收量進行可靠估算。利用這些信息,在進行高成本的下游測序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實驗中遇到的問題。這些指標(biāo)允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進行跟蹤。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺,助力您的深入科學(xué)探究。

多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進程!烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀(jì)元。深圳BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機構(gòu)

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對于單細(xì)胞測序而言,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項分析,并且數(shù)據(jù)分析時以細(xì)胞聚類(cell cluster)為討論對象,而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細(xì)胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴(yán)格,但是單細(xì)胞測序,特別是目的為圖譜研究時,需要通過提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此,單細(xì)胞測序?qū)嶒炘O(shè)計時首先需要保證生物學(xué)重復(fù),不同樣本來源的樣本建議單獨進行細(xì)胞解離和捕獲、建庫、測序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),單個樣本分別捕獲細(xì)胞時,后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準(zhǔn)確性。南京scRNA單細(xì)胞平臺

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。烈冰生物是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),一直“以人為本,服務(wù)于社會”的經(jīng)營理念;“誠守信譽,持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團隊,具有單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序等多項業(yè)務(wù)。烈冰生物自成立以來,一直堅持走正規(guī)化、專業(yè)化路線,得到了廣大客戶及社會各界的普遍認(rèn)可與大力支持。