深圳BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-16

基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實(shí)視圖。烈冰自2019年引進(jìn)的BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)以來,能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實(shí)驗(yàn),也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性,因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過計(jì)算來推斷各個(gè)組學(xué)之間的關(guān)系。烈冰生物作為BD 中國聯(lián)合成立單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)室,為推動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展貢獻(xiàn)中國力量。深圳BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí),需要在細(xì)胞清洗和過濾之后測(cè)定細(xì)胞活力,這一點(diǎn)至關(guān)重要。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法,烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性,取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞。一旦過濾和清洗完成,可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備(如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀)進(jìn)行定量。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù),還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積。無錫BD VDJ單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測(cè)序文庫,通過對(duì)文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào),獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法(Sanger法等)相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,從平臺(tái)應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,靶點(diǎn)探索,免疫研究,神經(jīng)發(fā)育,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發(fā)表期刊水平來看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,烈冰專屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章?;诖胖锽arcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu),精細(xì)區(qū)分上萬個(gè)細(xì)胞中mRNA的來源及表達(dá)豐度。

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。截至2022年6月,烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章30+篇。廣州BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)

搭配BD FACSMelody流式分選儀,全線搭建BD Rahpsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。深圳BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)

由于高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本,使得單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴,烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺(tái)搭建前,我們測(cè)試評(píng)估了BD Rhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲(chǔ)的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序(每個(gè)細(xì)胞月8700個(gè)讀數(shù))。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1109個(gè)細(xì)胞的上樣條件下,每個(gè)細(xì)胞中,來自每個(gè)細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測(cè)為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1000個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個(gè)細(xì)胞下小于5%。深圳BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。在社會(huì)各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造***服務(wù)體驗(yàn),為客戶成功提供堅(jiān)實(shí)有力的支持。