北京scRNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-17

Single Cell Sequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了,如何獲得單個(gè)細(xì)胞?如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無(wú)法普及。所以,正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個(gè)單細(xì)胞測(cè)序突破性技術(shù)的誕生。此外,烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,歡迎垂詢(xún)。北京scRNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,存在各種情況的序列污染。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征,即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類(lèi)型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。濟(jì)南single cell 單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無(wú)憂(yōu)服務(wù)。

多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶(hù)定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!

相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問(wèn)題,BD平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測(cè)序細(xì)胞量,特殊研究需求的項(xiàng)目,可提供上限40000個(gè)細(xì)胞的捕獲量(單個(gè)樣本)。這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說(shuō)能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類(lèi)型。因此,對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無(wú)論是從細(xì)胞數(shù)量上來(lái)說(shuō)還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來(lái)說(shuō),都會(huì)更實(shí)用。此外針對(duì)特殊項(xiàng)目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺(tái)也有更好的捕獲效能,滿(mǎn)足您的實(shí)際需求。自2019年起,烈冰生物BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。

烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)體系,不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國(guó)際認(rèn)可的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),在“附加”產(chǎn)品上,我們提供BD FACS Melody流式細(xì)胞儀,滿(mǎn)足您對(duì)特殊細(xì)胞類(lèi)型的富集需求,自主研發(fā)的Panocell單細(xì)胞捕獲芯片,可兼容BD 平臺(tái)全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細(xì)胞多組學(xué)解決方案。從細(xì)胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測(cè)試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡(jiǎn)方案和專(zhuān)業(yè)團(tuán)隊(duì)技術(shù)支持,烈冰生物可為您提供用于單細(xì)胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的各種工具,助您加速科研探索之旅。BD Rhapsody平臺(tái)在細(xì)胞捕獲過(guò)程中沒(méi)有偏好性,可同樣無(wú)差別捕獲中性粒細(xì)胞。濟(jì)南single cell 單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)

BD Scanner,是您實(shí)驗(yàn)過(guò)程的又一雙眼睛,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),精細(xì)質(zhì)控。北京scRNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)

對(duì)于稀有樣本,或細(xì)胞量比較少的稀有組織,樣本中每一粒細(xì)胞都很珍貴,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)該種類(lèi)型的樣本能實(shí)現(xiàn)友好包容,如果在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中,我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢?lèi)型和制備單細(xì)胞懸液方法的不同,容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況。也會(huì)和您探討是否考慮去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物的操作,以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因?yàn)?,死亡的?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái)。這種cell-free RNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲,并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí),對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后,需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作),以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量。北京scRNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營(yíng)品牌有NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,該公司服務(wù)型的公司。是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),隨著市場(chǎng)的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,與多家企業(yè)合作研究,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過(guò)不斷改進(jìn),追求新型,在強(qiáng)化內(nèi)部管理,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí),良好的質(zhì)量、合理的價(jià)格、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評(píng)。公司始終堅(jiān)持客戶(hù)需求優(yōu)先的原則,致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。