青島single cell 單細胞多組學測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-22

關(guān)于單細胞測序?qū)嶒灅颖局苽洌@與流式細胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機械消化、細胞分選或其他細胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液。隨后是細胞計數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當濃度的活細胞,并且不含細胞團塊和死細胞碎片。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進行染色,標記細胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗目標而定。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細胞大小,以及是否需要提取出細胞核進行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生成高質(zhì)量的單細胞懸液。自2019年起,烈冰生物BD單細胞測序平臺已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。青島single cell 單細胞多組學測序

根據(jù)烈冰多年單細胞測序服務經(jīng)驗,為什么不建議您一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個細胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當細胞捕獲數(shù)過多時,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù),都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時,數(shù)據(jù)量在100G左右時,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。廣州BD VDJ單細胞轉(zhuǎn)錄組測序烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。

機體為響應各種應激,其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況,構(gòu)建細胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細胞測序?qū)嶒灲M中心,多地部署搭建BD Rhapsody單細胞實驗平臺,基于微孔的強大的高通量單細胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標記系統(tǒng),對高通量單細胞進行多組學的信息捕獲,由此捕獲的信息科進一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫。之后對文庫進行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,實現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達差異和表達豐度。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量BD 單細胞測序服務。

針對BD Rhapsody單細胞捕獲平臺,烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識:BD Rhapsody試劑是轉(zhuǎn)為 Rhapsody 系統(tǒng)設(shè)計,旦性能已得到驗證的產(chǎn)品,因此研究人員可以專注于解決生物學問題,而不必花費時間應對多組學分析的技術(shù)障礙。此外,我們還提基于BD平臺的單細胞多組學服務,如Ab-Seq檢測試劑盒使用的抗體已在流式細胞分析中得到充分研究,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對生物學系統(tǒng)的理解。作為BD中國單細胞聯(lián)合實驗室的合作伙伴,我們將繼續(xù)擴展檢測試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍,以支持前沿多組學分析。我們經(jīng)驗豐富的專業(yè)客戶服務團隊可在多組學分析的各個方面為您提供幫助。烈冰生物全國五大實驗中心,多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺,助您的樣本更快速抵達“戰(zhàn)場”。長沙BD單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

單細胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強有力的工具。青島single cell 單細胞多組學測序

Single Cell Sequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個細胞?如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細胞?單個組織細胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細胞?單細胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候,如果單個細胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無法普及。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足,直到幾個單細胞測序突破性技術(shù)的誕生。青島single cell 單細胞多組學測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。