寧波BD Rhapsody單細胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-25

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細胞捕獲系統(tǒng),首先,該系統(tǒng)的技術原理是基于cyto-seq的微孔技術,因此不會因為樣本細胞體積太大或懸液背景太雜等問題導致捕獲通道的堵塞進而導致樣本的損失;其次,BD RhapsodyTM單細胞捕獲系統(tǒng)無電子元件,便于攜帶,當您的樣本需及時實驗時,我們可以“拎包上門”,快速的完成細胞捕獲部分,不至于珍貴樣本因細胞活性快速下降帶來的損失;在這,BD Rhapsody單細胞捕獲系統(tǒng)對細胞數量包容性較好,細胞懸液上樣量高達575ul,針對樣本中細胞數量較少的組織類型,也能完成整個項目的細胞捕獲工作。截至2022年6月,烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章30+篇。寧波BD Rhapsody單細胞測序

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節(jié)寬、高和系數比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。陜西BD VDJ單細胞服務機構自2019年起,烈冰生物BD單細胞測序平臺已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。

針對單細胞測序的細胞數量判斷環(huán)節(jié):主要是對細胞數量、基因表達量、測序質量進行整體描述。過濾標準:由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會存在一些死細胞,導致數據存在background值。因此,我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例,細胞數量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,當存在多個斜率拐點的時候,結合預期UMI=500時的細胞數量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候,選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準;否則,選擇和預期細胞數量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數量上可以分析的數據。

基因和基因產物并不是單獨運作的,而是參與了相互關聯(lián)的復雜通路、網絡和分子系統(tǒng),這些合在一起實現了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關重要。”為了推動科學發(fā)現,科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。單細胞測序技術的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強有力的工具。

單細胞測序技術(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細胞的異質性、免疫微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數據解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設備,保證了從單細胞懸液質量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的準確質控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關鍵關卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領域收獲更多的成果。烈冰科技已建立了多種國際和國內主流的高通量測序實驗平臺和自主研發(fā)國產化實驗平臺。云南BD VDJ單細胞多組學測序

BD平臺基于cyto-seq技術,實現細胞和磁珠的一對一結合。寧波BD Rhapsody單細胞測序

單細胞測序龐大的數據烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數據分析平臺,可實現零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數,UMI數量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。寧波BD Rhapsody單細胞測序

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