生命科學(xué)研究的目的之一就是為了解決細(xì)胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測(cè)序技術(shù)可提供特定條件下某些 組織中基因的表達(dá)信息，不僅可以推斷出相應(yīng)未知基因的功能，揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機(jī)制，而且可以辨別細(xì)胞的類(lèi)型和異質(zhì)性，為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同，傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)顯然不能夠滿足科研工作者們強(qiáng)烈的好奇心，更加直觀地反映組織中基因的表達(dá)情況，隨即單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（Spatial transcriptomics，ST）測(cè)序等一系列技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。烈冰專(zhuān)精空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序領(lǐng)域。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格
10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫(kù)構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域，每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)（barcodedspots），每個(gè)點(diǎn)的直徑為55μm，點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100μm，并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA，遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列，然后進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建并進(jìn)行測(cè)序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來(lái)自哪個(gè)位置，從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。武漢烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序助您深入探究細(xì)胞類(lèi)型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征。
所謂的高通量測(cè)序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測(cè)序，是將DNA（或者cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測(cè)序文庫(kù)，通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法相比，高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì)，又快（兩天）又多（數(shù)百萬(wàn)克隆），成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程，開(kāi)展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見(jiàn)解是否與您的研究問(wèn)題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開(kāi)始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開(kāi)始了，從銷(xiāo)售到實(shí)驗(yàn)到專(zhuān)業(yè)技術(shù)支持，我們開(kāi)通全線對(duì)接渠道，幫助您快速定位項(xiàng)目訴求，提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程，我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。
空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在病理學(xué)中，通過(guò)添加基因表達(dá)維度，得出形態(tài)學(xué)結(jié)論，通過(guò)觀察基因表達(dá)區(qū)域，了解可能發(fā)生假陰性/假陽(yáng)性的位置; 在免疫學(xué)，研究免疫細(xì)胞浸潤(rùn)、不同區(qū)域的免疫細(xì)胞中的基因表達(dá)特征；免疫群體擴(kuò)散、不同類(lèi)型免疫細(xì)胞的空間位置解析； 在神經(jīng)科學(xué)，研究大腦皮層層狀組織解析，揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系，正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達(dá)于特定的大腦皮層； 在發(fā)育生物學(xué)，通過(guò)解析每個(gè)發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達(dá)特征，解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因；豐富基因表達(dá)的空間注釋信息，創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細(xì)胞圖譜。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文！烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。
細(xì)胞在組織樣本中的相對(duì)空間位置關(guān)系對(duì)于了解疾病病理學(xué)非常重要。但是scRNA-Seq在單細(xì)胞懸液制備的過(guò)程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)，無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個(gè)問(wèn)題，通過(guò)記錄組織切片細(xì)胞的空間信息，捕獲組織切片中的組織學(xué)信息；通過(guò)免疫熒光進(jìn)行蛋白組檢測(cè)，將基因表達(dá)譜映射回組織樣本中的原始位置，同時(shí)獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學(xué)，發(fā)育生物學(xué)，免疫生理學(xué)等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達(dá)情況的新視角。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000，開(kāi)啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。青島空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)公司
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空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時(shí)間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會(huì)影響總的有效spot數(shù)等；而透化不合理會(huì)導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達(dá)方面，我們也可以統(tǒng)計(jì)空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene，將他們?cè)诮M織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對(duì)于任意一個(gè)已知的基因或者數(shù)據(jù)庫(kù)中的一些細(xì)胞Marker，然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解，群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格
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