廣州高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-10

空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進(jìn)行分析,例如,利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時(shí)期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號(hào)通路及其關(guān)鍵基因的較大情況,揭示在特定發(fā)育時(shí)期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學(xué)過程。針對(duì)任何一個(gè)基因,空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達(dá)該基因的點(diǎn)陣及其空間排布;單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達(dá)的細(xì)胞類群;原位測(cè)序可以給出該基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)狀況。通過不同發(fā)育時(shí)間點(diǎn)的信息比較,可以分析細(xì)胞類群在某個(gè)部位在不同時(shí)間點(diǎn)的差異,給出其在細(xì)胞內(nèi)的真實(shí)的演變狀況。助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息;助力生命健康醫(yī)療大時(shí)代!廣州高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性:對(duì)于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細(xì)胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班。 2.建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個(gè)人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對(duì)生物體組織間的細(xì)胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍(lán)區(qū)胚胎發(fā)育的動(dòng)態(tài)過程是科研人員一直為之著迷的,空間組學(xué)發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍(lán)圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。10xGenomics公司已經(jīng)測(cè)試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結(jié)、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟廈門上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序機(jī)構(gòu),請(qǐng)認(rèn)準(zhǔn)上海烈冰生物科技。

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程:1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時(shí)間不盡相同,在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)前,需要利用組織優(yōu)化kit進(jìn)行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個(gè)捕獲區(qū)域,每個(gè)區(qū)域均覆蓋了熒光標(biāo)記探針,可捕獲mRNA形成帶有熒光標(biāo)簽的cDNA,隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時(shí)間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序確定組織優(yōu)化條件后,即可進(jìn)行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序分析流程。

當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時(shí),通過透化處理,細(xì)胞內(nèi)的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機(jī)測(cè)序,可以將每個(gè)mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點(diǎn)在于芯片部分:正式文庫(kù)構(gòu)建的芯片上有4個(gè)捕獲區(qū)域(6.5mmX6.5mm,可以檢測(cè)4個(gè)樣本)每個(gè)捕獲區(qū)域含有約5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)(barcodedspots)每個(gè)spot直徑55μm,每個(gè)spot能捕獲1-10個(gè)細(xì)胞spot與spot中心點(diǎn)之間的距離為100μm每個(gè)spot含有上百萬個(gè)可以與mRNA結(jié)合的捕獲探針,每個(gè)探針上都帶有獨(dú)特的spatialbarcodes,用以標(biāo)記捕獲的mRNA的空間位置??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務(wù),包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫(kù)測(cè)序以及后續(xù)的FISH驗(yàn)證等各個(gè)步驟,為您提供無憂服務(wù)。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機(jī)、尼康多熒光通路全自動(dòng)掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進(jìn)實(shí)驗(yàn)平臺(tái),并制定嚴(yán)格規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP,經(jīng)過大量的切片、貼片實(shí)操演練,對(duì)不同類型組織的切片厚度、溫度進(jìn)行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺(tái),搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,準(zhǔn)確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,判定空間區(qū)域內(nèi)的細(xì)胞類別,精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息。國(guó)產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái),提供高性價(jià)比服務(wù)方案。寧波高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化

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轉(zhuǎn)錄組分析指對(duì)細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序一般是對(duì)用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進(jìn)行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進(jìn)行高通量測(cè)序。相對(duì)于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺(tái),轉(zhuǎn)錄組測(cè)序無需預(yù)先針對(duì)已知序列設(shè)計(jì)探針,即可對(duì)任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測(cè),提供更精確的數(shù)字化信號(hào),是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時(shí)獲得空間表達(dá)和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進(jìn)行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進(jìn)行表達(dá)定量。廣州高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

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