蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-13

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,節(jié)省您的工作時(shí)間并提升整體工作效率。單細(xì)胞組學(xué)通過(guò)一系列測(cè)序技術(shù)實(shí)現(xiàn)高分辨檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞水平表達(dá)譜,以解析細(xì)胞異質(zhì)性及其功能表型。蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái)

SingleCellSequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了,如何獲得單個(gè)細(xì)胞?如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無(wú)法普及。所以,正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個(gè)突破性技術(shù)的誕生。北京single cell 單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持隨著組學(xué)新技術(shù)的不斷涌現(xiàn),高通量的方向發(fā)展,通過(guò)對(duì)多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析,已成為科研究新方向。

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與單細(xì)胞測(cè)序的結(jié)果不同,這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn)。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá)。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了。如果組織沒(méi)有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒(méi)有基因表達(dá),即無(wú)有效Spot位點(diǎn)。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,也就是說(shuō)組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展解決了以往群體細(xì)胞組學(xué)分析面臨的兩個(gè)瓶頸:一是大量細(xì)胞的混合測(cè)序會(huì)掩蓋細(xì)胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測(cè)序技術(shù)需要大量的細(xì)胞作為起始,細(xì)胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細(xì)胞測(cè)序方法不僅能夠揭示組織中的細(xì)胞類型和稀有亞群、細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)的變化,還可以研究細(xì)胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育、衰老和疾病發(fā)展的機(jī)制。隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組、蛋白組等各組學(xué)測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展,研究者開(kāi)始將它們相互組合,使得單個(gè)細(xì)胞或同類細(xì)胞的多個(gè)組學(xué)數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)能夠更有效地研究細(xì)胞在特定時(shí)空狀態(tài)下各組學(xué)間的復(fù)雜聯(lián)系,從而揭示細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)調(diào)控的分子機(jī)制。未來(lái),單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的策略會(huì)繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個(gè)組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展。

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(SingleCellSequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測(cè)序手段,幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了BulkPopulationSequencing所無(wú)法解決的問(wèn)題。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來(lái)支撐。BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評(píng)估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過(guò)程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的完善質(zhì)控。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對(duì)單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域收獲更多的成果。單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)已應(yīng)用于心肌再生領(lǐng)域。深圳scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

以單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為中心的多組學(xué)聯(lián)合分析有利于更好地理解基因變化與表型變化之間的關(guān)聯(lián)性。蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái)

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測(cè)序文庫(kù),通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬(wàn)克?。?,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開(kāi)展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見(jiàn)解是否與您的研究問(wèn)題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開(kāi)始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開(kāi)始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開(kāi)通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái)

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