單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是一種在單細(xì)胞水平上對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀(guān)組等進(jìn)行高通量測(cè)序分析的技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性。單細(xì)胞水平細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評(píng)選的科學(xué)突破。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)
相比于常規(guī)的測(cè)序手段,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序有幾個(gè)明顯的優(yōu)勢(shì):1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對(duì)應(yīng),體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性:每個(gè)區(qū)域獨(dú)特的條形碼使測(cè)序結(jié)果與空間位置形成一一對(duì)應(yīng)關(guān)系。雖然暫時(shí)還無(wú)法精細(xì)到單細(xì)胞層面,但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對(duì)全組織進(jìn)行分析:芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個(gè)反應(yīng)中完成測(cè)序,能有效降低多次重復(fù)實(shí)驗(yàn)中的誤差。測(cè)序結(jié)果如果不按照條形碼歸類(lèi),則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況,無(wú)需再做單獨(dú)檢測(cè)。3.為進(jìn)一步的研究提供指導(dǎo)意見(jiàn):常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)的指導(dǎo)仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序則可以標(biāo)識(shí)出更有價(jià)值的研究區(qū)域,引導(dǎo)研究者將組織進(jìn)一步細(xì)分。烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機(jī)構(gòu)十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域的佼佼者。
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測(cè)定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。
烈冰科技作為國(guó)內(nèi)同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過(guò)多年實(shí)戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn),實(shí)測(cè)BDRhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái)、建庫(kù)方法,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來(lái)自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì),為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航??臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,揭示精細(xì)病理區(qū)域的信號(hào)通路。
烈冰生物真正實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的全程把控,做到從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、空間信息標(biāo)記、建庫(kù)測(cè)序、定制化分析的全流程一站式服務(wù),助力高分文章發(fā)表;專(zhuān)業(yè)實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)保證樣本的高度一致性;專(zhuān)業(yè)的生物學(xué)團(tuán)隊(duì)提供個(gè)性化的產(chǎn)品應(yīng)用場(chǎng)景解讀、保持對(duì)生物學(xué)意義的關(guān)注;強(qiáng)大的生信分析團(tuán)隊(duì)一對(duì)一地進(jìn)行詳實(shí)科學(xué)的實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)并提供多次售后分析;可接受樣品類(lèi)別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預(yù)冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進(jìn)行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標(biāo)明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運(yùn)輸過(guò)程需要在低溫環(huán)境全線(xiàn)搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái)。廈門(mén)scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)
烈冰智造空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞捕獲,媲美國(guó)際主流的單細(xì)胞平臺(tái)。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)
冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在RNA捕獲、文庫(kù)構(gòu)建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,通過(guò)甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進(jìn)行透化處理,使細(xì)胞中的mRNA釋放,并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行上機(jī)測(cè)序,從而獲取基因表達(dá)信息??傮w來(lái)說(shuō),空間轉(zhuǎn)錄組的實(shí)驗(yàn)流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫(kù)-上機(jī)測(cè)序,而需要客戶(hù)進(jìn)行樣本準(zhǔn)備的步驟相對(duì)簡(jiǎn)單:組織凍存與OCT包埋。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢(xún),市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃,市場(chǎng)信息咨詢(xún)與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除專(zhuān)控),軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè)。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專(zhuān)業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專(zhuān)注和執(zhí)著為客戶(hù)提供單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶(hù)創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶(hù)的成長(zhǎng)共贏。