成都BD Rhapsody空間轉錄組技術支持

來源: 發(fā)布時間:2022-08-15

在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中,組織內部的不同細胞經歷了復雜的生物學過程,因此,組織內部的異質性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內部的異質性包括細胞類型的異質性和空間位置的異質性兩個層面,細胞類型異質性可由單細胞測序來完美呈現,而空間位置的異質性,則需要可高通量地檢測全轉錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實現空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表。全線搭建10x Genomics空間轉錄組測序平臺。成都BD Rhapsody空間轉錄組技術支持

所謂的高通量測序技術,又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數百萬克?。蔀槟壳敖M學研究的主要技術??臻g轉錄組測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。青島烈冰生物空間轉錄組測序空間轉錄組測序,上海烈冰生物科技很靠譜。

單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組、轉錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規(guī)單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息??臻g轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經生物學、免疫生物學等領域的研究利器。

其實,空間轉錄組的概念早就已經存在了,目前已經發(fā)表的空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復雜、檢測精度不準確、基因和細胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內率先搭建空間轉錄組測序服務平臺,聯合上線單細胞核轉錄組測序、AbSeq、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉錄組測序產品結合scRNA-Seq服務,多組學聯合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學信息。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案!烈冰專精空間轉錄組測序領域。

空間轉錄組測序的關鍵就在于,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區(qū)域內的冰凍組織切片在經過H&E染色和成像記錄后,會被進行透化處理,釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區(qū)域。芯片被劃分為了數個不同的捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區(qū)域對應的組織位置會被記錄下來,然后再進行測序后,通過條形碼將不同區(qū)域的測序結果,映射到對應的組織位置上,拼貼形成組織樣品的空間轉錄組圖像。十二年測序經驗,累計服務與5000余項重要科研項目。scRNA空間轉錄組數據分析可視化

高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。成都BD Rhapsody空間轉錄組技術支持

多樣本數據合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!成都BD Rhapsody空間轉錄組技術支持

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術創(chuàng)新和產品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團隊。公司以誠信為本,業(yè)務領域涵蓋單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,我們本著對客戶負責,對員工負責,更是對公司發(fā)展負責的態(tài)度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司深耕單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領域拓展。