杭州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

來源: 發(fā)布時間:2022-08-15

空間組測序技術,作為現(xiàn)階段單細胞技術的重要補充技術進入了組學的實驗領域以及生物信息學的分析領域。通過單細胞測序(單細胞表達尺度)+空間轉(zhuǎn)錄組測序(空間表達尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉(zhuǎn)錄組分析實際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,一個在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán),也是重中之重。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。杭州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復雜、檢測精度不準確、基因和細胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序、AbSeq、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務,多組學聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學信息。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案!青島空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序助您深入探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征。

單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質(zhì)性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領域的研究利器。

在轉(zhuǎn)錄組學領域,空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學評價為2020年度方法,空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序,這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?,F(xiàn)在,新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息,同時還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置,進一步擴展到單細胞分辨率,這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。

高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗,已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學研究視角。西安高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組測序服務

十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領域的佼佼者。杭州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!杭州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

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