解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析;擁有行業(yè)先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀,可以同時實現(xiàn)明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式,進一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細采集;能夠滿足針對分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達與定位信息。國產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,提供高性價比服務(wù)方案。高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)
生命科學(xué)研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術(shù)可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息,不僅可以推斷出相應(yīng)未知基因的功能,揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機制,而且可以辨別細胞的類型和異質(zhì)性,為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同,傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心,更加直觀地反映組織中基因的表達情況,隨即單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空間轉(zhuǎn)錄組(Spatial transcriptomics,ST)測序等一系列技術(shù)應(yīng)運而生。青島BD空間轉(zhuǎn)錄組測序價格烈冰開展了空間轉(zhuǎn)錄組、單細胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。
細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息。
空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段:1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分;2.Spot點陣的分群與定義;3.Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺,其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的,都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可,左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后,采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析,解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。深度的空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代。
已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細胞數(shù)量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息。烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司
烈冰智造空間轉(zhuǎn)錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)
在轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域,空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評價為2020年度方法,空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領(lǐng)組學(xué)在生物學(xué)的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序,這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?,F(xiàn)在,新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息,同時還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置,進一步擴展到單細胞分辨率,這會更大程度提升科學(xué)家對單個細胞的認識和解讀。高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】,是一家醫(yī)藥健康的企業(yè),擁有自己**的技術(shù)體系。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才,以不斷增強企業(yè)重點競爭力,加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,實現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,深受客戶好評。公司深耕單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。