廈門單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-22

二代測(cè)序技術(shù)在測(cè)序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測(cè)序”(sequencingbysynthesis)和大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)(massiveparallelanalysis,MPS),使測(cè)序通量和讀取速度得到極大提升,烈冰生物斥巨資購(gòu)置的Novaseq6000測(cè)序儀的測(cè)序原理可以簡(jiǎn)化為四步:樣品文庫(kù)構(gòu)建、簇生成、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長(zhǎng)限制,樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3和5端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來(lái)源;2)Adapter,用于結(jié)合測(cè)序通道上的位點(diǎn);3)Primerbindingsite,用于結(jié)合PCR引物啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。廈門單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展解決了以往群體細(xì)胞組學(xué)分析面臨的兩個(gè)瓶頸:一是大量細(xì)胞的混合測(cè)序會(huì)掩蓋細(xì)胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測(cè)序技術(shù)需要大量的細(xì)胞作為起始,細(xì)胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細(xì)胞測(cè)序方法不僅能夠揭示組織中的細(xì)胞類型和稀有亞群、細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)的變化,還可以研究細(xì)胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育、衰老和疾病發(fā)展的機(jī)制。隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組、蛋白組等各組學(xué)測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展,研究者開(kāi)始將它們相互組合,使得單個(gè)細(xì)胞或同類細(xì)胞的多個(gè)組學(xué)數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)能夠更有效地研究細(xì)胞在特定時(shí)空狀態(tài)下各組學(xué)間的復(fù)雜聯(lián)系,從而揭示細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)調(diào)控的分子機(jī)制。上海高通量測(cè)序單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持單細(xì)胞多組學(xué)的研究對(duì)生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn),細(xì)胞分化發(fā)育研究等均有重要意義。

分子檢測(cè)型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù),結(jié)合了強(qiáng)大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運(yùn)決定之間的因果關(guān)系。在未來(lái),為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動(dòng)關(guān)系對(duì)細(xì)胞命運(yùn)的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的策略會(huì)繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個(gè)組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)會(huì)轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測(cè)序分析和功能驗(yàn)證同時(shí)進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對(duì)于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。

reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中:以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,例如成熟的B,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某一疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過(guò)1萬(wàn),這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。單細(xì)胞多組學(xué)可從整體層面快速有效地探尋疾病發(fā)生、發(fā)展的根本原因或藥物作用靶點(diǎn)等信息。

基因測(cè)序是基因檢測(cè)的方法之一,其又叫基因譜測(cè)序,是國(guó)際上公認(rèn)的一種基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定,被稱為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing),足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測(cè)序(deepsequencing)。基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,可以說(shuō),基因測(cè)序技術(shù)將是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)整合了單細(xì)胞各個(gè)組學(xué)特征, 提供了揭示細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其互動(dòng)關(guān)系的機(jī)會(huì)。杭州single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析

目前單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)仍然處于技術(shù)探索及高通量開(kāi)發(fā)階段,但應(yīng)用單細(xì)胞多組學(xué)分析是研究發(fā)展的必然趨勢(shì)。廈門單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。廈門單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序價(jià)格

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