深圳烈冰科技空間轉錄組平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-08-30

空間轉錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,得出形態(tài)學結論,通過觀察基因表達區(qū)域,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,研究免疫細胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經科學,研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結構-功能關系,正常vs.疾病大腦結構特征分析與疾病相關的基因表達于特定的大腦皮層; 在發(fā)育生物學,通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達特征,解析組織中與形態(tài)形成相關基因;豐富基因表達的空間注釋信息,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細胞圖譜。烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。深圳烈冰科技空間轉錄組平臺

空間轉錄組研究的的必耍性:研究單細胞是想要探究細胞間的異質性,但是常規(guī)的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液,然后利用單細胞分離技術(微孔,微板,液滴)等方法實現(xiàn)單細胞建庫,這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中是非常重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發(fā)展空問轉錄組技術實現(xiàn)細胞的位置信息的保留,對研究此類細胞狀態(tài)尤為必要。合肥烈冰科技空間轉錄組測序高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。

冰凍切片的空間轉錄組測序在RNA捕獲、文庫構建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結合捕獲探針的載玻片上,通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結構。再進行透化處理,使細胞中的mRNA釋放,并結合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉錄合成cDNA并構建測序文庫進行上機測序,從而獲取基因表達信息??傮w來說,空間轉錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序,而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋。

空間轉錄組測序的數(shù)據(jù)質量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質量和透化時間息息相關。貼片質量不良會影響總的有效spot數(shù)等;而透化不合理會導致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達方面,我們也可以統(tǒng)計空間轉錄組群體的特異性基因表達即Markergene,將他們在組織切片以及空轉上進行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細胞Marker,然后將其在基因表達在空間轉錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達進而了解,群體中的可能的細胞組成關系。烈冰生物全轉錄組測序通過雙文庫構建,實現(xiàn)多種RNA的一網打盡。

烈冰與國內高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊,已發(fā)表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉移機制,免疫研究、腦神經、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等??臻g轉錄組測序可識別重要的轉錄因子,進行譜系和發(fā)育追蹤。上海scRNA空間轉錄組測序服務

空間轉錄組測序技術提供了空間轉錄組水平下的科學研究視角。深圳烈冰科技空間轉錄組平臺

生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發(fā)、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業(yè)務,計算機、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】是我國國民經濟重要組成部分之一,具有高產出、高危險、高技術密集型特點,有很強的技術壁壘。而且對于保護和增進大家健康、提高生活質量,為計劃生育、救災防疫、軍需戰(zhàn)備以及促進經濟發(fā)展和社會進步均具有十分重要的作用。打造一批以為依托的“互聯(lián)網+醫(yī)藥健康”協(xié)作平臺。這定將給相關企業(yè),帶來非常大的發(fā)展機遇。2019年醫(yī)藥健康新政頻出,無論是醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)還是生產企業(yè),都面臨了很多挑戰(zhàn)??傮w而言,健康科技行業(yè)前景光明。在過去五年里,這一行業(yè)的穩(wěn)健增長已經給未上市有限責任公司(自然)公司帶來逾270億美元的收入,14家公司的估值超過10億美元。另外,2019年退出總價值已經超過2018年,達到創(chuàng)紀錄的80億美元,這在很大程度上是因為強勁IPO的推動。隨著西方健康服務理念的進入及國內需求市場的飛速增長,國內以體檢為重點的有限責任公司(自然)得到了飛速發(fā)展,尤其是近年來,健康服務機構飛速發(fā)展。盡管中國老年健康服務目前仍處于初始發(fā)展階段,但近年來我國出臺了一些扶持政策,市場空間逐漸打開。深圳烈冰科技空間轉錄組平臺

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