深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-30

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測(cè)序文庫(kù),通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬(wàn)克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問(wèn)題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域的佼佼者。深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來(lái),烈冰依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),為用戶提供一站式全流程的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)和解決方案。烈冰經(jīng)過(guò)十幾年的經(jīng)歷,已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。青島BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持烈冰開展了空間轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案。

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與單細(xì)胞測(cè)序的結(jié)果不同,這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn)。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá)。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達(dá),即無(wú)有效Spot位點(diǎn)。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,也就是說(shuō)組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。

烈冰生物真正實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的全程把控,做到從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、空間信息標(biāo)記、建庫(kù)測(cè)序、定制化分析的全流程一站式服務(wù),助力高分文章發(fā)表;專業(yè)實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學(xué)團(tuán)隊(duì)提供個(gè)性化的產(chǎn)品應(yīng)用場(chǎng)景解讀、保持對(duì)生物學(xué)意義的關(guān)注;強(qiáng)大的生信分析團(tuán)隊(duì)一對(duì)一地進(jìn)行詳實(shí)科學(xué)的實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預(yù)冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進(jìn)行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標(biāo)明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運(yùn)輸過(guò)程需要在低溫環(huán)境空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學(xué)研究視角。

空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性:對(duì)于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細(xì)胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班。 2.建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個(gè)人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對(duì)生物體組織間的細(xì)胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍(lán)區(qū)胚胎發(fā)育的動(dòng)態(tài)過(guò)程是科研人員一直為之著迷的,空間組學(xué)發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍(lán)圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。10xGenomics公司已經(jīng)測(cè)試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結(jié)、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟附加流式分選細(xì)胞表面Marker,對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,助力高要求測(cè)序項(xiàng)目。合肥高通量測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴(kuò)增成千上萬(wàn)倍,保證過(guò)程中足夠的測(cè)序深度。測(cè)序時(shí)使用特殊標(biāo)記的dNTP:1)堿基上通過(guò)敏感鍵修飾上不同的熒光基團(tuán),用于區(qū)分ATCG;2)3端使用疊氮基團(tuán)封閉,保證一次循環(huán)只上一個(gè)dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時(shí),會(huì)通過(guò)高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團(tuán)和疊氮基團(tuán),開啟下一循環(huán)。通過(guò)分析讀取同一位點(diǎn)的熒光,實(shí)時(shí)獲取模版鏈的堿基序列。由于過(guò)程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控,隨著循環(huán)數(shù)的增大會(huì)出現(xiàn)不同步的情況,因此Illumina的讀長(zhǎng)只能限制在200bp左右。深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

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